93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0828 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
335 aa  686    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1108  TPR repeat-containing protein  55.28 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.894333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1468  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 
368 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1110  hypothetical protein  72 
 
 
73 aa  86.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.991334  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
927 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
523 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2025  hypothetical protein  27.15 
 
 
666 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0517  hypothetical protein  27.72 
 
 
1134 aa  56.6  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1490  peptidase C39, bacteriocin processing  23.46 
 
 
199 aa  56.2  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  27.59 
 
 
417 aa  56.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 
573 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  29.05 
 
 
164 aa  53.5  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.81 
 
 
465 aa  52.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  27.27 
 
 
398 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
435 aa  51.2  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 
207 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 
465 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1976  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 
1400 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.04 
 
 
632 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2200  tetratricopeptide repeat protein  26.49 
 
 
1400 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228728 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1994  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 
1400 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.55 
 
 
1694 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
909 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2632  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.66 
 
 
1385 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
878 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.11 
 
 
261 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2240  hypothetical protein  25.66 
 
 
1400 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274881  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
260 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2545  tetratricopeptide domain-containing protein  30.82 
 
 
672 aa  49.3  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216986  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.99 
 
 
750 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  26.99 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.15 
 
 
810 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.76 
 
 
297 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2185  tetratricopeptide repeat protein  26.49 
 
 
1400 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  27.1 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
836 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3132  tetratricopeptide repeat protein  26.49 
 
 
1400 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0761546 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.76 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  32.56 
 
 
322 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0723  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0862368  normal  0.0366717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 
243 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
562 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2013  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 
1402 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.61 
 
 
576 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 
605 aa  47  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.77 
 
 
373 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  31.39 
 
 
743 aa  46.6  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
955 aa  46.6  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0088  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 
275 aa  46.2  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.124171 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0719  peptidase C39 bacteriocin processing  30.61 
 
 
164 aa  46.2  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  23.7 
 
 
560 aa  46.2  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
739 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
750 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
4079 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.19 
 
 
466 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.6 
 
 
707 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
436 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2322  tetratricopeptide repeat protein  25 
 
 
1400 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155443  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.81 
 
 
725 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 
357 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3619  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
234 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
1737 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
1276 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 
543 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  26.71 
 
 
745 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  26.56 
 
 
594 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 
3035 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 
311 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  26.21 
 
 
564 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 
4489 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
1827 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 
366 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 
716 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  30.58 
 
 
529 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.5 
 
 
406 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.5 
 
 
465 aa  43.5  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  22.14 
 
 
376 aa  43.5  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0324  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 
234 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.5 
 
 
406 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 
1049 aa  43.1  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0357  TPR domain-containing protein  26.82 
 
 
234 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000167049  decreased coverage  0.00000000909482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4589  TPR repeat-containing protein  48.57 
 
 
226 aa  43.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.82 
 
 
1979 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
681 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
637 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  26.53 
 
 
706 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  32.29 
 
 
347 aa  42.7  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.47 
 
 
884 aa  42.7  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 
388 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 
466 aa  42.7  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 
512 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 
388 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0359  TPR repeat-containing protein  48.57 
 
 
230 aa  42.7  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>