More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0781 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  100 
 
 
444 aa  915  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  61.52 
 
 
435 aa  579  1e-164  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  45.87 
 
 
450 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  43.49 
 
 
453 aa  337  3e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  40.22 
 
 
434 aa  329  6e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  32.34 
 
 
445 aa  225  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  29.49 
 
 
455 aa  215  1e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  31.71 
 
 
420 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  32.05 
 
 
405 aa  209  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  30.16 
 
 
430 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  30.16 
 
 
430 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  30.16 
 
 
430 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  30.16 
 
 
430 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  30.16 
 
 
430 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  30.16 
 
 
430 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  30.16 
 
 
430 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  31.96 
 
 
430 aa  206  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  31.14 
 
 
405 aa  206  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  29.93 
 
 
430 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  29.93 
 
 
430 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  29.93 
 
 
430 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  31.38 
 
 
441 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  9.08978e-08 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  31.44 
 
 
404 aa  198  2e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  28.57 
 
 
466 aa  197  4e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  28.83 
 
 
467 aa  192  8e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  30.07 
 
 
436 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  27.13 
 
 
475 aa  189  6e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  29.84 
 
 
437 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  28.9 
 
 
469 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  27.06 
 
 
467 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  30.91 
 
 
447 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  30.77 
 
 
446 aa  187  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  26.61 
 
 
477 aa  186  1e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  30.19 
 
 
396 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  27.23 
 
 
479 aa  184  4e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0987  SufBD protein  29.77 
 
 
423 aa  184  4e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137837  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  30.02 
 
 
440 aa  183  5e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.75 
 
 
470 aa  183  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  29.74 
 
 
445 aa  182  8e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  28.25 
 
 
487 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  28.05 
 
 
470 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.23 
 
 
470 aa  181  3e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  28.34 
 
 
465 aa  181  3e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  26.15 
 
 
470 aa  179  6e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  31.28 
 
 
437 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  29.47 
 
 
428 aa  179  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  29.82 
 
 
436 aa  179  9e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  29.95 
 
 
439 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  28.31 
 
 
487 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  29.4 
 
 
426 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  27.98 
 
 
473 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  27.33 
 
 
472 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  26.77 
 
 
485 aa  178  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  26.15 
 
 
466 aa  177  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  29.4 
 
 
426 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  26.15 
 
 
472 aa  177  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  26.36 
 
 
476 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  28.15 
 
 
420 aa  177  4e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  29.84 
 
 
441 aa  177  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  28.01 
 
 
469 aa  177  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.9 
 
 
490 aa  176  7e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  26.38 
 
 
466 aa  176  8e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  28.81 
 
 
442 aa  175  1e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  25.11 
 
 
476 aa  175  2e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  29.62 
 
 
428 aa  175  2e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  29.86 
 
 
428 aa  175  2e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  26.9 
 
 
471 aa  175  2e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  28.28 
 
 
479 aa  174  3e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  27.69 
 
 
468 aa  174  3e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  27.46 
 
 
479 aa  174  3e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  26.09 
 
 
481 aa  174  4e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  26.54 
 
 
480 aa  174  4e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  26.9 
 
 
481 aa  173  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  27.36 
 
 
485 aa  173  6e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  27.36 
 
 
487 aa  173  7e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  27.36 
 
 
487 aa  173  7e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  27.36 
 
 
487 aa  173  7e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  26.21 
 
 
499 aa  172  8e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.09 
 
 
483 aa  172  9e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  26.92 
 
 
469 aa  172  9e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  7.85433e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  27.23 
 
 
479 aa  172  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.51 
 
 
470 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  28.24 
 
 
444 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  27.36 
 
 
485 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  25.46 
 
 
472 aa  171  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  28.41 
 
 
420 aa  171  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  27.69 
 
 
471 aa  170  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  27.87 
 
 
429 aa  170  5e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0174  SufBD protein  26.92 
 
 
404 aa  169  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  28.44 
 
 
439 aa  169  7e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  27.33 
 
 
481 aa  169  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  25.63 
 
 
470 aa  169  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  26.54 
 
 
472 aa  169  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  25.23 
 
 
465 aa  168  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  24.55 
 
 
476 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  27.23 
 
 
439 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0489  SufBD protein  29.18 
 
 
417 aa  168  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  29.88 
 
 
434 aa  167  3e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.44 
 
 
482 aa  167  3e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  29.37 
 
 
437 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>