27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0720 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0720  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  580  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3019  hypothetical protein  46.95 
 
 
311 aa  264  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  67.47 
 
 
412 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  54.67 
 
 
409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0111  PEGA domain protein  55.49 
 
 
416 aa  185  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  55.77 
 
 
426 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1560  S-layer-like protein array-related protein  36.94 
 
 
303 aa  169  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.39656 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1316  S-layer-like protein array-related protein  48.91 
 
 
426 aa  163  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0814  PEGA domain-containing protein  45.16 
 
 
341 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0391  S-layer-like protein array-related protein  48.19 
 
 
196 aa  156  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0608317  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  34.55 
 
 
684 aa  77.8  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  26.82 
 
 
456 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  26.82 
 
 
456 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0923  hypothetical protein  31.58 
 
 
122 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2901  hypothetical protein  27.07 
 
 
274 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000575173  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7209  OmpA/MotB domain protein  27.59 
 
 
652 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0110011 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4059  serine/threonine protein kinase  29.1 
 
 
657 aa  52.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6051  OmpA/MotB domain protein  26 
 
 
642 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2505  hypothetical protein  41.67 
 
 
134 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2610  hypothetical protein  37.68 
 
 
122 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.980948  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.64 
 
 
843 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.15 
 
 
841 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2383  hypothetical protein  31.63 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0932192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1609  S-layer-like protein array-related protein-like protein  29.91 
 
 
472 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2071  hypothetical protein  25.93 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.686043  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2370  putative exported protease/peptidase  22.15 
 
 
208 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0426298 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0519  serine/threonine protein kinase  27.34 
 
 
639 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>