More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0710 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 
806 aa  1595    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0406  cytochrome c oxidase, subunit I  57.97 
 
 
818 aa  937    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  77.42 
 
 
796 aa  1200    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  46.34 
 
 
615 aa  504  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  43.47 
 
 
641 aa  489  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  43.7 
 
 
641 aa  488  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  45.28 
 
 
611 aa  477  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  45.04 
 
 
620 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  45.21 
 
 
620 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  34.79 
 
 
879 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  34.79 
 
 
879 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  45.04 
 
 
620 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  44.86 
 
 
620 aa  474  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  44.86 
 
 
620 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  44.72 
 
 
623 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  45.04 
 
 
620 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  45.1 
 
 
611 aa  475  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  35.25 
 
 
879 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  45.57 
 
 
620 aa  474  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  35.01 
 
 
882 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  44.86 
 
 
620 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  46.05 
 
 
552 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  35.1 
 
 
876 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  44.86 
 
 
620 aa  462  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  46.52 
 
 
564 aa  458  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  33.57 
 
 
874 aa  458  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  45.78 
 
 
564 aa  456  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  43.08 
 
 
661 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  47.91 
 
 
594 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  45.81 
 
 
589 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  42.96 
 
 
662 aa  455  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  45.1 
 
 
566 aa  450  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  46.77 
 
 
590 aa  452  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  46.48 
 
 
575 aa  452  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  44.57 
 
 
565 aa  452  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  46.21 
 
 
594 aa  450  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  43.75 
 
 
563 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  46.77 
 
 
581 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  47.24 
 
 
593 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  45.52 
 
 
588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  43.73 
 
 
556 aa  445  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  44.74 
 
 
540 aa  443  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1290  cytochrome c oxidase, subunit I  45.49 
 
 
564 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372246  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  43.83 
 
 
563 aa  443  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  42.23 
 
 
535 aa  445  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  46.85 
 
 
596 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  48.28 
 
 
582 aa  446  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  44.05 
 
 
555 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1448  cytochrome-c oxidase  42.61 
 
 
631 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0923755 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5243  cytochrome c oxidase, subunit I  42.01 
 
 
637 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407043  normal  0.600413 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  44.27 
 
 
619 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  43.83 
 
 
563 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  45.29 
 
 
548 aa  445  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  45.63 
 
 
590 aa  446  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  47.13 
 
 
572 aa  445  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  46.72 
 
 
555 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4647  cytochrome c oxidase subunit I type  47.15 
 
 
540 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608702  normal  0.13111 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  35.2 
 
 
743 aa  442  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  47.44 
 
 
540 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  46.72 
 
 
555 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  47.98 
 
 
582 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0983  cytochrome c oxidase subunit I type  46.67 
 
 
585 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.615245  decreased coverage  0.000770913 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  45.67 
 
 
548 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  46.81 
 
 
560 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4277  cytochrome-c oxidase  47.63 
 
 
580 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.415183  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5377  cytochrome-c oxidase  48.39 
 
 
581 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  44.25 
 
 
541 aa  438  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  42.37 
 
 
671 aa  438  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2818  cytochrome-c oxidase  48.58 
 
 
581 aa  438  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4179  cytochrome c oxidase, subunit I  45.45 
 
 
557 aa  438  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263418  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  46.84 
 
 
542 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  46.65 
 
 
534 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1349  cytochrome c oxidase, subunit I  48.85 
 
 
585 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  45.95 
 
 
638 aa  437  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3704  cytochrome-c oxidase  48.39 
 
 
581 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574025  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  47.48 
 
 
589 aa  438  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  46.46 
 
 
594 aa  438  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_002978  WD0301  cytochrome c oxidase, subunit I  44.71 
 
 
516 aa  433  1e-120  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  46.27 
 
 
541 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3458  cytochrome c oxidase, subunit I  45.76 
 
 
542 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1016  cytochrome-c oxidase  46.47 
 
 
563 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  42.51 
 
 
545 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1094  cytochrome-c oxidase  46.45 
 
 
644 aa  434  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  43.81 
 
 
635 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  44.64 
 
 
563 aa  434  1e-120  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  44.73 
 
 
542 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5670  cytochrome-c oxidase  48.2 
 
 
581 aa  436  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  45.96 
 
 
542 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  43.8 
 
 
583 aa  434  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6145  cytochrome c oxidase, subunit I  34.65 
 
 
1004 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.440203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4587  cytochrome-c oxidase  46.65 
 
 
541 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0148874  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  45.56 
 
 
542 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5341  cytochrome-c oxidase  48.2 
 
 
581 aa  436  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  45.29 
 
 
558 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  45.17 
 
 
557 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  44.77 
 
 
541 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3724  cytochrome c oxidase, subunit I  46.78 
 
 
602 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  46.06 
 
 
535 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  47.82 
 
 
581 aa  435  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  46.94 
 
 
567 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>