More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0709 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 
355 aa  734    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  59.27 
 
 
351 aa  428  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  36.12 
 
 
435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  35.33 
 
 
370 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  34.43 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  39.29 
 
 
345 aa  192  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  34.75 
 
 
311 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  33.97 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  33.97 
 
 
349 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  33.97 
 
 
349 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  33.97 
 
 
349 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  33.97 
 
 
349 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  33.97 
 
 
349 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  33.97 
 
 
349 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  33.65 
 
 
349 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  34.19 
 
 
349 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  36.54 
 
 
356 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  33.65 
 
 
349 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  33.02 
 
 
349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  34.13 
 
 
356 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  37.25 
 
 
330 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  32.52 
 
 
352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  32.82 
 
 
346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  31.27 
 
 
326 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  32.26 
 
 
338 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  34.5 
 
 
324 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  32.48 
 
 
336 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  34.39 
 
 
324 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  33.56 
 
 
371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  31.02 
 
 
353 aa  153  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  34.19 
 
 
324 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  38.22 
 
 
322 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  32.78 
 
 
334 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  34.93 
 
 
314 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  32.01 
 
 
334 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  32.66 
 
 
354 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 
425 aa  149  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  30 
 
 
359 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  34.98 
 
 
318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  30 
 
 
352 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  30.79 
 
 
372 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  30.92 
 
 
352 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  30.46 
 
 
381 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  30.46 
 
 
372 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  28.35 
 
 
398 aa  143  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  28.33 
 
 
338 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  29.94 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  31.8 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  31.66 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  31.48 
 
 
434 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  32.57 
 
 
330 aa  139  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  28 
 
 
355 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  29.43 
 
 
346 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  27.54 
 
 
388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  31.27 
 
 
385 aa  137  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  28.87 
 
 
342 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.94 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  30.23 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  30.82 
 
 
353 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  29.81 
 
 
327 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  30.48 
 
 
385 aa  132  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  28.57 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  29.57 
 
 
370 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  29.45 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  29.45 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  30.33 
 
 
389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  28.9 
 
 
373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  28.91 
 
 
402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 
390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  37.22 
 
 
290 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  30.66 
 
 
344 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  28.99 
 
 
380 aa  125  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  37.17 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  25.91 
 
 
520 aa  125  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  28.18 
 
 
392 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  28.97 
 
 
401 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  29.97 
 
 
337 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  29.97 
 
 
337 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.33 
 
 
421 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  30.54 
 
 
318 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  29.33 
 
 
366 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  29.33 
 
 
374 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  28.46 
 
 
418 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  28.46 
 
 
418 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  29.12 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  28.53 
 
 
380 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  33.19 
 
 
286 aa  120  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  30.89 
 
 
337 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  27.94 
 
 
390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  32.79 
 
 
257 aa  119  6e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  28.18 
 
 
375 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  27.9 
 
 
375 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  25.14 
 
 
532 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  29.84 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  27.9 
 
 
375 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  25.41 
 
 
525 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  28.84 
 
 
330 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  29.6 
 
 
329 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>