More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0612 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  100 
 
 
164 aa  333  7.999999999999999e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  65.49 
 
 
153 aa  190  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  46.48 
 
 
282 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  45.11 
 
 
174 aa  99  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
302 aa  97.4  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  48.09 
 
 
248 aa  97.4  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 
270 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 
270 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  42.96 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 
270 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  46.62 
 
 
203 aa  95.5  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 
268 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  43.36 
 
 
169 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
158 aa  92.8  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  42.96 
 
 
149 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
272 aa  92.8  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 
182 aa  91.3  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 
142 aa  90.9  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  42.66 
 
 
166 aa  90.9  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  43.36 
 
 
160 aa  89  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  39.46 
 
 
143 aa  87.8  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
150 aa  87.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
141 aa  84.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  43.66 
 
 
424 aa  81.3  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  40 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  40 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  40 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  39.85 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  37.88 
 
 
336 aa  71.2  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  37.96 
 
 
258 aa  71.2  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 
206 aa  70.5  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  37.68 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
322 aa  68.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  36.62 
 
 
430 aa  68.6  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  34.62 
 
 
305 aa  68.2  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  35.51 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  37.21 
 
 
308 aa  64.7  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
341 aa  64.3  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
310 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 
229 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  34.13 
 
 
231 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
324 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
144 aa  63.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 
303 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
322 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
299 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  34.38 
 
 
314 aa  62  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  33.11 
 
 
292 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 
139 aa  60.8  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  35.81 
 
 
322 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.43 
 
 
315 aa  60.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
211 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 
296 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
289 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 
303 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
216 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
136 aa  58.5  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
301 aa  58.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 
356 aa  58.2  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
126 aa  58.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
333 aa  57.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 
153 aa  57.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
137 aa  57.8  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 
314 aa  57.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
143 aa  57.4  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  38.39 
 
 
160 aa  57.4  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
326 aa  57.4  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 
143 aa  57.4  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
195 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
216 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
166 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
302 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  28.15 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  30.66 
 
 
143 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.29 
 
 
577 aa  53.9  0.0000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 
158 aa  53.9  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  28.35 
 
 
153 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  28.35 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  28.35 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>