16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0576 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0576  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  344  3e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00845502  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0565  RAD52/22 double-strand break repair protein  86.39 
 
 
169 aa  307  5e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.103803 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3545  RAD52/22 double-strand break repair protein  85.71 
 
 
170 aa  306  8e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  5.61994e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1314  Rad52/22 double-strand break repair protein  60.61 
 
 
179 aa  206  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.321327  normal  0.202591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0517  Rad52/22 double-strand break repair protein  39.75 
 
 
167 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.743906  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2527  Rad52/22 double-strand break repair protein  39.62 
 
 
170 aa  103  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00242809  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0080  prophage protein  38.26 
 
 
118 aa  79.3  3e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.568604  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0086  prophage protein  38.26 
 
 
118 aa  79.3  3e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2129  hypothetical protein  36 
 
 
252 aa  79  3e-14  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0052  putative prophage protein  39.09 
 
 
282 aa  79  3e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.012266 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0612  gp49  37.4 
 
 
235 aa  74.7  6e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0180237  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2611  Rad52/22 double-strand break repair protein  32.24 
 
 
238 aa  71.6  5e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0322  hypothetical protein  40.52 
 
 
242 aa  62.8  2e-09  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1173  hypothetical protein  31.36 
 
 
211 aa  56.6  1e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  7.29431e-06  normal  0.496656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0535  hypothetical protein  28.86 
 
 
151 aa  48.5  5e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0977  Rad52/22 double-strand break repair protein  31.75 
 
 
201 aa  48.1  6e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  1.68807e-09  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>