15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0501 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0501  hypothetical protein  100 
 
 		 647 aa  1294    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000301954  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  53.28 
 
 		 1002 aa  587  1e-166  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  51.75 
 
 		 1006 aa  542  1e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  30.6 
 
 		 868 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  30.6 
 
 		 868 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  30.6 
 
 		 868 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  25.44 
 
 		 867 aa  196  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0075  hypothetical protein  31.17 
 
 		 397 aa  143  9e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  29.78 
 
 		 1776 aa  105  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4396  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1050 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.360797 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  27.97 
 
 		 845 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  24.51 
 
 		 841 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2708  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1038 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00403632  hitchhiker  0.00987423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  26.18 
 
 		 633 aa  45.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  27.21 
 
 		 955 aa  43.9  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>