More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0437 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  59.51 
 
 
518 aa  636  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  60.12 
 
 
500 aa  648  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  63.86 
 
 
498 aa  645  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  61.05 
 
 
503 aa  650  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  60.53 
 
 
500 aa  649  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  59.39 
 
 
499 aa  636  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  67.48 
 
 
505 aa  676  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  62.07 
 
 
501 aa  652  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  60.12 
 
 
499 aa  639  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  60.12 
 
 
499 aa  636  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  61.65 
 
 
510 aa  642  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  59.84 
 
 
496 aa  642  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.55688e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  61.69 
 
 
501 aa  653  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  59.84 
 
 
496 aa  641  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.18027e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  59.84 
 
 
496 aa  640  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.30334e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  60.53 
 
 
500 aa  649  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  60.32 
 
 
500 aa  649  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  62.96 
 
 
496 aa  682  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  63.16 
 
 
496 aa  642  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  59.51 
 
 
518 aa  636  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  59.51 
 
 
518 aa  636  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  61.94 
 
 
496 aa  675  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  59.51 
 
 
518 aa  636  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  61.59 
 
 
507 aa  643  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  60.04 
 
 
496 aa  639  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.15642e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  59.51 
 
 
518 aa  636  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  63.03 
 
 
497 aa  652  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  61.13 
 
 
498 aa  663  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  60.32 
 
 
500 aa  649  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  60.04 
 
 
496 aa  639  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  2.69449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  63.77 
 
 
497 aa  682  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  60.53 
 
 
500 aa  649  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  62.55 
 
 
497 aa  654  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  59.84 
 
 
496 aa  640  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  64.17 
 
 
496 aa  638  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  63.62 
 
 
516 aa  653  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  59.51 
 
 
503 aa  635  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  75.15 
 
 
496 aa  781  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  62.6 
 
 
502 aa  651  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  62.65 
 
 
496 aa  639  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  59.84 
 
 
496 aa  642  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.37015e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  62.6 
 
 
513 aa  671  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5647e-05 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  59.84 
 
 
496 aa  641  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.62863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  59.51 
 
 
503 aa  635  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  100 
 
 
520 aa  1055  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  1.12542e-06  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  68.02 
 
 
496 aa  685  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.21066e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  59.72 
 
 
500 aa  639  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  63.82 
 
 
497 aa  651  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  60.98 
 
 
505 aa  637  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  60.04 
 
 
496 aa  642  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  9.10223e-06  decreased coverage  9.61259e-09 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  60.93 
 
 
505 aa  656  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  59.84 
 
 
496 aa  642  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  60.53 
 
 
501 aa  640  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  61.43 
 
 
496 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.99841e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  59.88 
 
 
501 aa  631  1e-180  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  61.17 
 
 
497 aa  632  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  60.36 
 
 
498 aa  629  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  61.35 
 
 
494 aa  630  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0876  glycerol kinase  61.94 
 
 
497 aa  630  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  62.35 
 
 
497 aa  625  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  58.13 
 
 
494 aa  628  1e-178  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  58.91 
 
 
489 aa  625  1e-178  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  59.43 
 
 
495 aa  621  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  59.67 
 
 
495 aa  620  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  58.82 
 
 
493 aa  620  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  62.22 
 
 
498 aa  619  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  62.42 
 
 
498 aa  619  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  57.11 
 
 
501 aa  617  1e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  62.22 
 
 
499 aa  616  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0870  glycerol kinase  57.61 
 
 
495 aa  612  1e-174  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.758789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  58.7 
 
 
499 aa  612  1e-174  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  57.52 
 
 
498 aa  612  1e-174  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  58.7 
 
 
499 aa  612  1e-174  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  56.63 
 
 
507 aa  612  1e-174  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  61.74 
 
 
497 aa  613  1e-174  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  58.66 
 
 
494 aa  612  1e-174  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  58.18 
 
 
500 aa  614  1e-174  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  58.59 
 
 
500 aa  614  1e-174  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  59.43 
 
 
499 aa  614  1e-174  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1347  glycerol kinase  59.11 
 
 
498 aa  613  1e-174  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0455293  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  58.25 
 
 
494 aa  612  1e-174  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  57.78 
 
 
502 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  57.81 
 
 
502 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3334  glycerol kinase  59.35 
 
 
498 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.921166  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  57.81 
 
 
502 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  57.81 
 
 
502 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3376  glycerol kinase  58.82 
 
 
495 aa  610  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  58.22 
 
 
502 aa  609  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  61.13 
 
 
497 aa  610  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  57.81 
 
 
502 aa  608  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  58.3 
 
 
499 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  58.3 
 
 
501 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  57.81 
 
 
507 aa  609  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  57.81 
 
 
502 aa  608  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  57.81 
 
 
507 aa  609  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  57.81 
 
 
502 aa  608  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  57.81 
 
 
502 aa  608  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  57.81 
 
 
502 aa  608  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  59.35 
 
 
498 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  57.81 
 
 
502 aa  608  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>