More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0420 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  100 
 
 
511 aa  1033    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.02 
 
 
511 aa  523  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.05 
 
 
478 aa  323  5e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  35.87 
 
 
520 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.96 
 
 
698 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.49 
 
 
528 aa  266  7e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  33.01 
 
 
517 aa  258  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  36.15 
 
 
604 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  45.24 
 
 
503 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  46.42 
 
 
520 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.71 
 
 
618 aa  240  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.59 
 
 
596 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.98 
 
 
558 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  40.32 
 
 
444 aa  237  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.62 
 
 
543 aa  236  9e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  43.05 
 
 
365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  29.59 
 
 
845 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.99 
 
 
426 aa  234  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.71 
 
 
365 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.71 
 
 
365 aa  233  9e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.35 
 
 
600 aa  231  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.12 
 
 
387 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  42.41 
 
 
656 aa  227  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.72 
 
 
594 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  45.97 
 
 
499 aa  226  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.25 
 
 
580 aa  226  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  44.71 
 
 
492 aa  225  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.82 
 
 
484 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.86 
 
 
504 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  44.04 
 
 
365 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  43 
 
 
427 aa  223  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  45.97 
 
 
498 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.52 
 
 
482 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  43.64 
 
 
490 aa  220  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  42.12 
 
 
552 aa  219  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.08 
 
 
543 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  43.59 
 
 
631 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.7 
 
 
490 aa  216  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.87 
 
 
976 aa  215  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  35.66 
 
 
966 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  40.62 
 
 
990 aa  215  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  42.52 
 
 
543 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  43.4 
 
 
673 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  40.45 
 
 
538 aa  212  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.72 
 
 
552 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.12 
 
 
534 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.12 
 
 
534 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  38.96 
 
 
370 aa  210  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  32.76 
 
 
592 aa  209  8e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  42.7 
 
 
542 aa  208  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  38.07 
 
 
363 aa  206  8e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.12 
 
 
365 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.61 
 
 
537 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  43.33 
 
 
633 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  31.97 
 
 
541 aa  204  3e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.31 
 
 
364 aa  204  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.97 
 
 
1018 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  43.57 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.58 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  27.72 
 
 
528 aa  201  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  41.13 
 
 
1007 aa  201  3e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  43.23 
 
 
637 aa  201  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  36.1 
 
 
971 aa  197  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.89 
 
 
583 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  31.15 
 
 
1012 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  35.96 
 
 
992 aa  196  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.6 
 
 
598 aa  195  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  33.88 
 
 
585 aa  194  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  32.84 
 
 
589 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.63 
 
 
568 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  38.58 
 
 
575 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1531  glycoside hydrolase family 3 protein  33.42 
 
 
478 aa  192  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000631966  unclonable  5.75811e-19 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  39.29 
 
 
1003 aa  191  2.9999999999999997e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  40.43 
 
 
699 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2523  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.34 
 
 
337 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  40.43 
 
 
699 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  40.94 
 
 
538 aa  189  7e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  35.05 
 
 
378 aa  189  9e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.55 
 
 
582 aa  189  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  37.23 
 
 
361 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  39.58 
 
 
699 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  37.65 
 
 
575 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  40.07 
 
 
699 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.54 
 
 
398 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  37.61 
 
 
420 aa  186  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0128  glycoside hydrolase family 3 protein  41.95 
 
 
475 aa  186  9e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.174382  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  38.6 
 
 
734 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  29.93 
 
 
688 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.23 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.92 
 
 
953 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.38 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  34.23 
 
 
997 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  42.53 
 
 
549 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1199  glycoside hydrolase family 3 protein  46.7 
 
 
483 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.95 
 
 
362 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  35.44 
 
 
557 aa  182  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.78 
 
 
1002 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07520  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.12 
 
 
499 aa  180  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.139948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.57 
 
 
530 aa  180  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  33.44 
 
 
375 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>