More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0391 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
119 aa  236  9e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  91.45 
 
 
120 aa  218  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  58.12 
 
 
176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  48.72 
 
 
141 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0580  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 
157 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  45.87 
 
 
143 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  45.76 
 
 
136 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  41.88 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0822  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 
141 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  45.69 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4080  thioesterase superfamily protein  45.87 
 
 
150 aa  96.7  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789165  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  45.28 
 
 
146 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3907  thioesterase superfamily protein  43.81 
 
 
158 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0682264  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  41.88 
 
 
132 aa  94.7  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4027  thioesterase superfamily protein  44.55 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000934062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0438  acyl-CoA hydrolase-like protein  48.11 
 
 
143 aa  94  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0096  thioesterase superfamily protein  47.37 
 
 
139 aa  93.6  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  44.14 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  41.53 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  45.3 
 
 
185 aa  92.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 
270 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  43.59 
 
 
154 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  43.59 
 
 
154 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  43.59 
 
 
154 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  43.59 
 
 
154 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  43.59 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  41.03 
 
 
127 aa  90.5  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1348  thioesterase superfamily protein  45.28 
 
 
158 aa  90.5  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  42.37 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  42.37 
 
 
143 aa  90.5  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  42.37 
 
 
143 aa  90.5  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  42.37 
 
 
143 aa  90.5  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.37 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  41.53 
 
 
145 aa  90.1  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  42.48 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  42.37 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  45.13 
 
 
128 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1278  acyl-CoA hydrolase  39.84 
 
 
136 aa  89.4  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  45.76 
 
 
187 aa  88.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  42.98 
 
 
185 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4028  thioesterase domain-containing protein  45.71 
 
 
131 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.210569  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  41.88 
 
 
149 aa  88.2  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0353  thioesterase superfamily protein  43.52 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3058  thioesterase superfamily protein  46.23 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0368  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  41.82 
 
 
128 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
129 aa  87.8  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3463  thioesterase superfamily protein  40.57 
 
 
155 aa  87.4  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.211669  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0390  thioesterase superfamily protein  42.45 
 
 
157 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
154 aa  87  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0477  hypothetical protein  43.64 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0392  thioesterase superfamily protein  44.76 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12158 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  40.68 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  39.09 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  40.71 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  41.18 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0671  thioesterase superfamily protein  44.76 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  41.12 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1269  conserved hypothetical protein, putative acyl-coA thioester hydrolase  36.59 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00039467  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1004  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.648637  normal  0.368957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1366  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147408  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1614  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00678446  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  40.74 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
260 aa  85.9  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3496  thioesterase superfamily protein  41.44 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  40.18 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  40.35 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  37.27 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  39.32 
 
 
131 aa  85.5  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  40.35 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2416  thioesterase family protein  43.81 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  41.82 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  40.68 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0203  thioesterase domain-containing protein  43.81 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0866  thioesterase superfamily protein  43.81 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2336  thioesterase domain-containing protein  43.81 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.600486  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  41.28 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0686  thioesterase family protein  43.81 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2742  thioesterase family protein  43.81 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  40.68 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0701  thioesterase family protein  43.81 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0451  thioesterase superfamily protein  41.51 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  37.27 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  41.03 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  38.6 
 
 
139 aa  84  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 
131 aa  84  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1460  putative long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  40.19 
 
 
129 aa  84  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1510  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase, putative  40.19 
 
 
129 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0349  thioesterase superfamily protein  43.64 
 
 
151 aa  83.6  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0571  thioesterase domain-containing protein  43.81 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0359  putative acyl-CoA thioester hydrolase  42.59 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183567  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0993  thioesterase family protein  36.07 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  38.98 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  38.98 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1457  thioesterase superfamily protein  40.18 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.412041  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0922  thioesterase family protein  36.07 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000350062  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>