123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0367 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  100 
 
 
688 aa  1353    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  35.46 
 
 
472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  43.6 
 
 
1361 aa  125  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  37.99 
 
 
1279 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  27.01 
 
 
940 aa  111  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  31.61 
 
 
436 aa  101  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  35.9 
 
 
430 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  27.63 
 
 
917 aa  96.7  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  27.68 
 
 
456 aa  93.2  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  42.56 
 
 
316 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.8 
 
 
752 aa  91.3  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  40.94 
 
 
981 aa  90.1  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  24.36 
 
 
501 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  26.07 
 
 
463 aa  87.8  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  27.97 
 
 
480 aa  88.2  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  34.86 
 
 
708 aa  85.9  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  41.86 
 
 
892 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  47.19 
 
 
1048 aa  84.3  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  29.1 
 
 
2638 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  37.56 
 
 
526 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  35.16 
 
 
1821 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  23.13 
 
 
938 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  28.03 
 
 
553 aa  77.8  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  27.27 
 
 
513 aa  77.4  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  26.89 
 
 
439 aa  76.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.3 
 
 
1272 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  26.43 
 
 
696 aa  74.7  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  50 
 
 
2122 aa  73.9  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  28 
 
 
485 aa  73.9  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  26.28 
 
 
1976 aa  73.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  26.72 
 
 
471 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  28.5 
 
 
432 aa  71.6  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  26.27 
 
 
1969 aa  71.2  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  35.84 
 
 
1009 aa  70.5  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  25.29 
 
 
3295 aa  68.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  33.16 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2465  surface protein, putative  32.99 
 
 
905 aa  66.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  27.03 
 
 
450 aa  66.6  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3038  hypothetical protein  50 
 
 
570 aa  65.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2284  Ig-like, group 2  38.42 
 
 
201 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  46.88 
 
 
1193 aa  65.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  38.04 
 
 
1316 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  36.91 
 
 
4630 aa  65.1  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  30.05 
 
 
399 aa  65.1  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2125  Ig domain-containing protein  32 
 
 
472 aa  64.3  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  24.53 
 
 
401 aa  64.7  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  46.84 
 
 
1732 aa  64.7  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  27.96 
 
 
840 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  21.18 
 
 
403 aa  63.5  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  32.29 
 
 
799 aa  63.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0371  Ig domain-containing protein  31.2 
 
 
472 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1066  hypothetical protein  42.59 
 
 
912 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  30.06 
 
 
1848 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0702  Ig domain-containing protein  29.38 
 
 
1281 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  26.67 
 
 
4433 aa  62  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  35.48 
 
 
570 aa  61.6  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2089  hypothetical protein  49.38 
 
 
850 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645532  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  34.44 
 
 
575 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  39.47 
 
 
2042 aa  60.8  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  34.72 
 
 
730 aa  60.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  23.44 
 
 
491 aa  60.1  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1889  Ig domain-containing protein  33.73 
 
 
331 aa  59.7  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  31.23 
 
 
2068 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  24.66 
 
 
528 aa  58.5  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  20.58 
 
 
400 aa  58.5  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  26.34 
 
 
2554 aa  58.5  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  29.06 
 
 
2286 aa  58.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3341  Ig domain-containing protein  35 
 
 
1180 aa  57.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498746  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  41.49 
 
 
490 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2713  Ig-like, group 2  36.31 
 
 
572 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  26.24 
 
 
1131 aa  55.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  29.11 
 
 
466 aa  55.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  34.74 
 
 
576 aa  54.7  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0764  hypothetical protein  48.78 
 
 
769 aa  54.3  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  27.23 
 
 
870 aa  53.9  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  41.18 
 
 
1732 aa  53.9  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  28.37 
 
 
3507 aa  53.9  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1304  hypothetical protein  30.97 
 
 
371 aa  53.9  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  23.9 
 
 
481 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  26.84 
 
 
812 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  23.53 
 
 
404 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1250  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  35.33 
 
 
740 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816915  normal  0.345768 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0926  Ig domain-containing protein  30.77 
 
 
449 aa  53.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2596  Ig domain-containing protein  23.98 
 
 
390 aa  52.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000321445  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3264  Ig domain-containing protein  31.36 
 
 
262 aa  52.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  26.94 
 
 
1300 aa  51.6  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2882  regulatory protein FlaEY  34.86 
 
 
950 aa  52  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0301569  normal  0.06195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  35.17 
 
 
437 aa  52  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  39.62 
 
 
480 aa  50.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  24.89 
 
 
408 aa  50.4  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  26.77 
 
 
460 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0820  Ig domain-containing protein  40.48 
 
 
482 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  27.97 
 
 
391 aa  50.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  35.97 
 
 
462 aa  50.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  25.38 
 
 
1152 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  27.58 
 
 
761 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_003296  RS01887  putative hemagglutinin-related protein  36.67 
 
 
446 aa  48.9  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3370  Ig domain-containing protein  37.78 
 
 
389 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  37.6 
 
 
2172 aa  48.5  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  24.91 
 
 
382 aa  48.5  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>