44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0364 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  100 
 
 		 428 aa  840    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25.19 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  29.24 
 
 		 512 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0802  O-antigen polymerase  28.16 
 
 		 470 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  28.41 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  22.89 
 
 		 436 aa  50.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  27.95 
 
 		 498 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0227  hypothetical protein  24.58 
 
 		 460 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  27.64 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3371  O-antigen polymerase  23.22 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  26.45 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  27.15 
 
 		 425 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  28.48 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  26.67 
 
 		 444 aa  47.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  23.41 
 
 		 459 aa  47  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0465  O-antigen polymerase  24.21 
 
 		 486 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.216322  normal  0.610525 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  26.45 
 
 		 443 aa  46.6  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  29.87 
 
 		 717 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  25.87 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0586  O-antigen polymerase  25.79 
 
 		 459 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  26.59 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  23.27 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  21.38 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  23.39 
 
 		 500 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  26.29 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  26.88 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1394  O-antigen polymerase  26.73 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0739482 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  23.02 
 
 		 428 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05350  O-antigen polymerase, Wzy protein  29.3 
 
 		 467 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00185086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  20.75 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0109  hypothetical protein  24.75 
 
 		 407 aa  44.7  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000538113 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  21.38 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  21.38 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  23.44 
 
 		 408 aa  44.3  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  23.44 
 
 		 408 aa  44.3  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  27.22 
 
 		 358 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4235  O-antigen polymerase  24.05 
 
 		 474 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000407687  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  21.38 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  21.38 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5250  O-antigen polymerase  28.28 
 
 		 336 aa  43.9  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  26.59 
 
 		 402 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  23.79 
 
 		 464 aa  43.5  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3179  O-antigen polymerase  23.89 
 
 		 453 aa  43.5  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.579286  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  29.7 
 
 		 467 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>