More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0313 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0313  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
216 aa  415  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1397  two component transcriptional regulator, winged helix family  80.28 
 
 
219 aa  344  6e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.0186572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 
225 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.87 
 
 
228 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 
225 aa  175  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  45 
 
 
226 aa  175  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  46.25 
 
 
246 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4346  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.4 
 
 
384 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0299016  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 
224 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 
224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 
270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 
225 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  42.04 
 
 
247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.97 
 
 
238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 
244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 
236 aa  161  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 
238 aa  161  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 
240 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2101  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 
228 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2388  heavy metal response regulator  48.21 
 
 
228 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000142984  normal  0.119734 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 
225 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  45.25 
 
 
229 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  42.41 
 
 
230 aa  158  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 
233 aa  158  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1307  DNA-binding heavy metal response regulator  44.75 
 
 
225 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150056  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 
231 aa  158  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 
230 aa  158  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 
227 aa  158  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 
226 aa  157  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 
228 aa  157  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 
236 aa  157  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 
235 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 
235 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 
231 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4663  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.75 
 
 
225 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 
236 aa  156  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  41.7 
 
 
252 aa  156  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  39.73 
 
 
233 aa  156  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 
224 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 
236 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1127  heavy metal response regulator  43.84 
 
 
225 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294376  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 
236 aa  155  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  38.05 
 
 
241 aa  155  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 
230 aa  155  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 
239 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 
239 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 
239 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  41.26 
 
 
233 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 
228 aa  155  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.1 
 
 
224 aa  155  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 
248 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 
224 aa  154  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0513  two component transcriptional regulator, winged helix family  47 
 
 
228 aa  154  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 
230 aa  154  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.69 
 
 
242 aa  154  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 
236 aa  154  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 
229 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1713  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.96 
 
 
227 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 
241 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  43.05 
 
 
234 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.97 
 
 
239 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.83 
 
 
234 aa  153  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 
233 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 
233 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  43.89 
 
 
229 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  40 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 
226 aa  152  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 
246 aa  152  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 
238 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 
406 aa  151  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 
232 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.01 
 
 
245 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 
273 aa  151  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0844  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 
228 aa  151  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000660959  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  39.73 
 
 
224 aa  151  8e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 
254 aa  151  8e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0692  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 
224 aa  151  8e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 
224 aa  151  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 
239 aa  151  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 
242 aa  151  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  42.86 
 
 
234 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4952  putative two-component response regulator  42.01 
 
 
227 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56950  putative two-component response regulator  41.55 
 
 
227 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 
228 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 
227 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 
234 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 
226 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 
257 aa  149  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  39.21 
 
 
235 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  37.72 
 
 
234 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 
245 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.06 
 
 
219 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.45 
 
 
224 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  42.59 
 
 
219 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>