More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0306 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
150 aa  313  6e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  64.38 
 
 
152 aa  187  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  52.48 
 
 
174 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  52.82 
 
 
158 aa  143  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  49.34 
 
 
155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  51.85 
 
 
172 aa  133  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  48.3 
 
 
173 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  46.71 
 
 
165 aa  131  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  48 
 
 
156 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  45.22 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  49.01 
 
 
154 aa  130  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  46.58 
 
 
158 aa  130  5e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  41.29 
 
 
157 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.29 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  46.1 
 
 
162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.62 
 
 
159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.1 
 
 
453 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  49.32 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  43.88 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  47.02 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  47.79 
 
 
166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  45.1 
 
 
165 aa  123  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  46.05 
 
 
162 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  45.58 
 
 
159 aa  120  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  46.94 
 
 
154 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  49.66 
 
 
152 aa  120  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  42.28 
 
 
161 aa  120  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  41.13 
 
 
160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  44.08 
 
 
160 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.48 
 
 
154 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 
160 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  46.94 
 
 
154 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  44.3 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  44.08 
 
 
160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  44.08 
 
 
160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  42.48 
 
 
154 aa  117  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  43.88 
 
 
154 aa  117  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  47.76 
 
 
155 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  43.92 
 
 
155 aa  117  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  43.88 
 
 
154 aa  116  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  43.88 
 
 
154 aa  116  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  43.88 
 
 
154 aa  116  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  43.88 
 
 
154 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  43.88 
 
 
154 aa  116  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  44 
 
 
155 aa  116  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 
163 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  43.51 
 
 
163 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0817  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.19 
 
 
186 aa  116  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.183565  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  44.59 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  40.76 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  43.23 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5030  protein tyrosine phosphatase  43.06 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  43.05 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  41.56 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  45.1 
 
 
157 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  44.22 
 
 
157 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  42.55 
 
 
162 aa  114  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  44.67 
 
 
159 aa  114  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18001  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40 
 
 
157 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.756832  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  43.84 
 
 
154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  41.83 
 
 
154 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  46.48 
 
 
154 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.05 
 
 
154 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  43.15 
 
 
154 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  43.15 
 
 
154 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  44.16 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  44.37 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  39.49 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  47.14 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.95 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3741  protein tyrosine phosphatase  43.45 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0796965  hitchhiker  0.00000000624838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4584  protein tyrosine phosphatase  41.56 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000111073  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 
160 aa  111  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  41.22 
 
 
166 aa  111  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17831  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.19 
 
 
157 aa  110  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  44.52 
 
 
166 aa  110  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  40.4 
 
 
188 aa  110  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  44.59 
 
 
167 aa  110  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2189  protein tyrosine phosphatase  43.92 
 
 
171 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.810234  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.54 
 
 
164 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.54 
 
 
164 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.54 
 
 
164 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.54 
 
 
164 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.54 
 
 
164 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  43.92 
 
 
171 aa  110  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  42.67 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.13 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  41.18 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.13 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  38.26 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  41.03 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2307  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.22 
 
 
161 aa  108  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3252  protein tyrosine phosphatase  42.36 
 
 
168 aa  108  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  hitchhiker  0.000187254 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  39.74 
 
 
155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17781  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.24 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  44 
 
 
160 aa  107  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1047  protein tyrosine phosphatase  45.27 
 
 
154 aa  107  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  43.45 
 
 
158 aa  107  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>