144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0289 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  100 
 
 
532 aa  1096  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  2.1727e-05  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  58.46 
 
 
523 aa  605  1e-172  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.33 
 
 
547 aa  553  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  53.64 
 
 
550 aa  550  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.1 
 
 
546 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.2 
 
 
541 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  50 
 
 
539 aa  502  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  49.91 
 
 
514 aa  500  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.92 
 
 
537 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  50.83 
 
 
537 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  50 
 
 
536 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  49.91 
 
 
541 aa  478  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  48.25 
 
 
540 aa  456  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.81 
 
 
559 aa  417  1e-115  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  44.9 
 
 
539 aa  411  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  39.68 
 
 
558 aa  391  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  36.52 
 
 
553 aa  331  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  39.07 
 
 
516 aa  317  4e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  37.45 
 
 
512 aa  309  9e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  34.04 
 
 
552 aa  307  4e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  34.52 
 
 
519 aa  282  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  38.77 
 
 
512 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  35.96 
 
 
563 aa  263  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.45 
 
 
538 aa  252  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  34.19 
 
 
581 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  32.15 
 
 
636 aa  246  7e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  4.12559e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  35.08 
 
 
517 aa  243  6e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  33.64 
 
 
566 aa  237  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  32.28 
 
 
577 aa  235  1e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  40 
 
 
497 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.54 
 
 
558 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.43 
 
 
515 aa  224  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  32.84 
 
 
546 aa  222  2e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  33.84 
 
 
484 aa  213  6e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  31.71 
 
 
496 aa  210  7e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  33.77 
 
 
542 aa  208  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  32.4 
 
 
556 aa  204  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  41.2 
 
 
492 aa  199  1e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  40.59 
 
 
586 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  32.95 
 
 
497 aa  196  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  40.2 
 
 
451 aa  191  3e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  41.41 
 
 
488 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  38.93 
 
 
526 aa  182  9e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 
498 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  27.66 
 
 
571 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  31.38 
 
 
546 aa  167  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  28.96 
 
 
591 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 
1195 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 
511 aa  148  2e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  33.23 
 
 
547 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  31.09 
 
 
537 aa  146  9e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  27.11 
 
 
551 aa  142  1e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  27.24 
 
 
560 aa  142  2e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  27.6 
 
 
572 aa  141  4e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.65 
 
 
562 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  26.51 
 
 
532 aa  135  1e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  28.18 
 
 
536 aa  134  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.61 
 
 
540 aa  132  2e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  30.89 
 
 
545 aa  132  2e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  30.4 
 
 
537 aa  131  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  31.61 
 
 
535 aa  130  7e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  28.39 
 
 
504 aa  129  9e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  26.99 
 
 
1474 aa  127  4e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  27.29 
 
 
665 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  29.32 
 
 
1338 aa  126  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  28.13 
 
 
543 aa  126  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  28.1 
 
 
522 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  30.07 
 
 
534 aa  124  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  26.37 
 
 
746 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  30.59 
 
 
527 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  26.96 
 
 
797 aa  121  4e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 
521 aa  119  1e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  27.69 
 
 
522 aa  117  4e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  25.5 
 
 
650 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  1.41623e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  27.32 
 
 
518 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  26.08 
 
 
525 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  28.31 
 
 
590 aa  114  4e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  27.79 
 
 
522 aa  113  8e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.35 
 
 
495 aa  113  1e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  26.75 
 
 
530 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  25.46 
 
 
532 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  27.09 
 
 
518 aa  107  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  32.44 
 
 
365 aa  104  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  25.72 
 
 
1585 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  24.77 
 
 
500 aa  100  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25.58 
 
 
522 aa  96.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  22.72 
 
 
472 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  24.26 
 
 
691 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  23.66 
 
 
524 aa  85.5  2e-15  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  23.28 
 
 
508 aa  85.9  2e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  7.97588e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  31.5 
 
 
345 aa  84.3  5e-15  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  34.12 
 
 
343 aa  82.4  2e-14  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  24.37 
 
 
501 aa  81.6  3e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  24.6 
 
 
503 aa  79.7  1e-13  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  1.88631e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  25.15 
 
 
472 aa  67.4  6e-10  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  27.31 
 
 
306 aa  67  7e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  5.40158e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  25.48 
 
 
901 aa  65.5  2e-09  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  26.74 
 
 
471 aa  62.4  2e-08  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  6.22549e-08  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02633  conserved hypothetical protein  46.48 
 
 
110 aa  62.8  2e-08  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.947242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  25.45 
 
 
341 aa  61.2  4e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>