143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0287 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 333 aa  684    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  48.26 
 
 		 371 aa  293  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  43.25 
 
 		 347 aa  286  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  43.25 
 
 		 347 aa  285  7e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  42.81 
 
 		 837 aa  281  8.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  42.17 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  47.08 
 
 		 474 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  45.25 
 
 		 477 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  41.4 
 
 		 488 aa  262  6.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  42.37 
 
 		 328 aa  261  8.999999999999999e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  41.4 
 
 		 503 aa  258  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  42.77 
 
 		 394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  40.73 
 
 		 491 aa  249  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  41.59 
 
 		 628 aa  249  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  43.17 
 
 		 383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  42.81 
 
 		 399 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  45.42 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  41.37 
 
 		 457 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  43.71 
 
 		 398 aa  235  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  40.06 
 
 		 495 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  38.83 
 
 		 678 aa  231  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  39.88 
 
 		 375 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  38.05 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  42.39 
 
 		 1037 aa  226  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  41.72 
 
 		 376 aa  225  7e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  36.98 
 
 		 373 aa  225  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  42.09 
 
 		 543 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  39.48 
 
 		 815 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  38.17 
 
 		 778 aa  223  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  41.69 
 
 		 497 aa  222  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  38.56 
 
 		 490 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  39.68 
 
 		 487 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  42.57 
 
 		 457 aa  219  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  39.58 
 
 		 689 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  40.96 
 
 		 829 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  35.69 
 
 		 820 aa  212  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  36.77 
 
 		 309 aa  212  9e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  40 
 
 		 451 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  35.6 
 
 		 364 aa  209  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  37.69 
 
 		 474 aa  209  6e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  38.66 
 
 		 1478 aa  208  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  35.82 
 
 		 407 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  38.66 
 
 		 756 aa  206  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  38.23 
 
 		 323 aa  206  6e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.37 
 
 		 697 aa  206  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  39.93 
 
 		 1001 aa  205  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  40.59 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  38.41 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  40.29 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  39.66 
 
 		 451 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  37.94 
 
 		 1041 aa  198  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  38.39 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  38.32 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  41 
 
 		 1019 aa  193  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  36.34 
 
 		 1059 aa  192  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  36.34 
 
 		 1059 aa  192  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  38.02 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  36.81 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  34.29 
 
 		 357 aa  189  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  34.87 
 
 		 486 aa  189  7e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  35.8 
 
 		 1018 aa  188  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  37.21 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  36.39 
 
 		 337 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  41.81 
 
 		 370 aa  186  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  35.8 
 
 		 465 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  35.8 
 
 		 1020 aa  183  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  38.67 
 
 		 359 aa  182  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  34.42 
 
 		 423 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  36.5 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  32.63 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  33.87 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  30.97 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  36.81 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  36.07 
 
 		 1050 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  34.74 
 
 		 374 aa  169  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  31.42 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  28.87 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  36.39 
 
 		 388 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  34.93 
 
 		 392 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  30.86 
 
 		 770 aa  152  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  31.45 
 
 		 1495 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  33.85 
 
 		 368 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  30.03 
 
 		 806 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  30.5 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0283938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  32.46 
 
 		 566 aa  146  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  34.39 
 
 		 690 aa  146  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  33.44 
 
 		 1077 aa  146  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  34.32 
 
 		 382 aa  145  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  31.12 
 
 		 619 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07401  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  29.87 
 
 		 355 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  31.99 
 
 		 561 aa  135  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  29.8 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  35.23 
 
 		 619 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  31.14 
 
 		 639 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  28.23 
 
 		 357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  29.1 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  32.36 
 
 		 2457 aa  126  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  32.12 
 
 		 912 aa  125  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.95 
 
 		 1146 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  34.6 
 
 		 1331 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>