More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0193 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
448 aa  869    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  55.3 
 
 
454 aa  453  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  42.86 
 
 
434 aa  323  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  38.97 
 
 
434 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  38.97 
 
 
434 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  34.85 
 
 
1833 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  36.26 
 
 
438 aa  266  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  36.98 
 
 
1816 aa  266  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 
437 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  34.25 
 
 
445 aa  234  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 
499 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
438 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
463 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 
432 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 
432 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 
433 aa  209  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  30.14 
 
 
439 aa  208  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  35.81 
 
 
495 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  34.34 
 
 
449 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  34.94 
 
 
449 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.18 
 
 
1864 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.48 
 
 
1876 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.31 
 
 
1829 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  26.83 
 
 
448 aa  189  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33.11 
 
 
2720 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  32.55 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  30.24 
 
 
414 aa  181  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.82 
 
 
1839 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.02 
 
 
1806 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  32.05 
 
 
472 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.35 
 
 
1776 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  32.58 
 
 
1769 aa  163  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  32.88 
 
 
425 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  33.6 
 
 
430 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  27.34 
 
 
441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1086  major facilitator superfamily protein  46.27 
 
 
134 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 
432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  26.44 
 
 
394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  27.68 
 
 
411 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  28.07 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1968  major facilitator transporter  30.53 
 
 
461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1647  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  27.03 
 
 
927 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  27.03 
 
 
927 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1732  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  27.03 
 
 
927 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1937  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  27.03 
 
 
927 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2296  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  27.03 
 
 
927 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200957  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2215  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  27.03 
 
 
927 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.360269  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0616  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  27.03 
 
 
927 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  28.73 
 
 
425 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
407 aa  114  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.67 
 
 
474 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 
412 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  25.66 
 
 
418 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  26.76 
 
 
397 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  23.35 
 
 
406 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25.63 
 
 
390 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25.63 
 
 
390 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
410 aa  106  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  25.2 
 
 
422 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  25.39 
 
 
422 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25.91 
 
 
422 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  23.35 
 
 
406 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  23.35 
 
 
406 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  23.35 
 
 
404 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  23.78 
 
 
406 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  23.08 
 
 
406 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  25.78 
 
 
422 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  25.07 
 
 
422 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  23.08 
 
 
406 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.24 
 
 
424 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
419 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  26.23 
 
 
422 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25.26 
 
 
422 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1259  major facilitator superfamily MFS_1  21.3 
 
 
445 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  25.07 
 
 
422 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  22.8 
 
 
404 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  23.48 
 
 
422 aa  96.7  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  28.75 
 
 
428 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  25 
 
 
422 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.59 
 
 
408 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  25 
 
 
422 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  27.54 
 
 
416 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.04 
 
 
408 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  30.43 
 
 
425 aa  94.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.1 
 
 
446 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  27.47 
 
 
416 aa  94.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 
420 aa  93.6  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  28.51 
 
 
414 aa  93.6  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  27.79 
 
 
450 aa  93.2  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  28.18 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  22.26 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.32 
 
 
408 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.04 
 
 
408 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1196  major facilitator transporter  23.95 
 
 
457 aa  91.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.897631  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.22 
 
 
413 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>