More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0174 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0174  aminotransferase class V  100 
 
 		 360 aa  730    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2387  aminotransferase class V  72.86 
 
 		 355 aa  530  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.271517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0713  aminotransferase, class V  39.55 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  36.65 
 
 		 379 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  39.48 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  32.87 
 
 		 387 aa  199  9e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.88 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  33.43 
 
 		 384 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  33.52 
 
 		 387 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  33.06 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  36.49 
 
 		 389 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  32.58 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  34.1 
 
 		 383 aa  192  8e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  35.69 
 
 		 382 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  35.69 
 
 		 382 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  32.21 
 
 		 379 aa  192  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  35.21 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  32.6 
 
 		 380 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.03 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  38.03 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  35.38 
 
 		 383 aa  186  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  35.1 
 
 		 385 aa  186  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  33.24 
 
 		 395 aa  186  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  30.81 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  31.2 
 
 		 384 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  31.2 
 
 		 384 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  33.43 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  34.71 
 
 		 382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  34.81 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  31.9 
 
 		 380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  35.29 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  32.1 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  34.88 
 
 		 382 aa  179  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  31.27 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  33.82 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  35.1 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  33.53 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  30.38 
 
 		 383 aa  176  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  33.52 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  35.57 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  30.79 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  34.25 
 
 		 385 aa  172  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  30.29 
 
 		 384 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  32.74 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  32.27 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  32.65 
 
 		 382 aa  168  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  32.02 
 
 		 362 aa  168  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  32.02 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.74 
 
 		 362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  31.74 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  32.66 
 
 		 421 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  32.78 
 
 		 417 aa  163  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  31.32 
 
 		 406 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3126  aminotransferase class V  37.15 
 
 		 390 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.38 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  31.67 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  31.32 
 
 		 406 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.29 
 
 		 383 aa  160  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  28.36 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  30.29 
 
 		 380 aa  159  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  30.75 
 
 		 406 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  30.5 
 
 		 381 aa  159  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  28.65 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  30 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  32.3 
 
 		 413 aa  156  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  28.9 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  30.47 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  32.66 
 
 		 377 aa  153  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  31.06 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  28.53 
 
 		 356 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44075  predicted protein  30.55 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  30.46 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  28.53 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  32.04 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  28.78 
 
 		 382 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  28.7 
 
 		 362 aa  149  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  33.9 
 
 		 376 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  30.83 
 
 		 387 aa  149  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  33.24 
 
 		 387 aa  149  7e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  33.24 
 
 		 395 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  29.6 
 
 		 406 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  28.78 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  28.53 
 
 		 381 aa  149  9e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  30.97 
 
 		 380 aa  149  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  32.95 
 
 		 373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  30.75 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  28.29 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  30.72 
 
 		 390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  30.58 
 
 		 414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  29.49 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  32.94 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  32.94 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  32.07 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  33.52 
 
 		 379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  29.65 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  26.63 
 
 		 357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  28.49 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  27.41 
 
 		 357 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  27.15 
 
 		 358 aa  146  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>