More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0101 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  100 
 
 
396 aa  746    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  89.14 
 
 
396 aa  597  1e-169  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  59.9 
 
 
400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  61.95 
 
 
401 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  48.24 
 
 
405 aa  299  6e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  47.37 
 
 
405 aa  292  8e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  48.74 
 
 
404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  44.7 
 
 
419 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  50.39 
 
 
404 aa  272  9e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  44.05 
 
 
414 aa  256  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  39.13 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  40.2 
 
 
408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  36.95 
 
 
426 aa  194  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2453  membrane anion transport protein  39.71 
 
 
413 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  39.15 
 
 
421 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  41.67 
 
 
413 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  41.97 
 
 
429 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  41.71 
 
 
418 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  41.71 
 
 
429 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3536  citrate transporter  37.28 
 
 
414 aa  169  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  29.12 
 
 
419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  30.62 
 
 
451 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  30.86 
 
 
441 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  30.14 
 
 
441 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  30.14 
 
 
441 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  30.14 
 
 
441 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  30.14 
 
 
441 aa  156  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  29.67 
 
 
441 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  30.38 
 
 
441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  30.38 
 
 
441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  30.38 
 
 
441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  30.38 
 
 
441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  30.17 
 
 
427 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  31.34 
 
 
421 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  27.62 
 
 
424 aa  150  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  30.6 
 
 
441 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  30.36 
 
 
441 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  36.58 
 
 
397 aa  149  9e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  28.95 
 
 
411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  31.49 
 
 
440 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  30.03 
 
 
423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  27.78 
 
 
422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  35.9 
 
 
413 aa  147  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  31.22 
 
 
427 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  30.83 
 
 
444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  32.99 
 
 
414 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  30.34 
 
 
441 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  29.8 
 
 
427 aa  145  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  30.53 
 
 
441 aa  144  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  30.37 
 
 
429 aa  142  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  30.1 
 
 
444 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  29.68 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  29.17 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  29.68 
 
 
444 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  29.68 
 
 
444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  29.68 
 
 
444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  29.68 
 
 
444 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  32.62 
 
 
422 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  31.81 
 
 
414 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  32.28 
 
 
417 aa  139  8.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  30.46 
 
 
415 aa  138  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  27.97 
 
 
427 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  28.04 
 
 
426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  31.11 
 
 
431 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  27.49 
 
 
428 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  29.95 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  29.37 
 
 
417 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  28.68 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  31.83 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  27.53 
 
 
425 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  29.12 
 
 
413 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  29.12 
 
 
413 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  28.72 
 
 
424 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  27.54 
 
 
431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  27.57 
 
 
421 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  30.79 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  27.42 
 
 
451 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  28.86 
 
 
440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  28.64 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  26.2 
 
 
425 aa  114  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  27.51 
 
 
424 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  25.56 
 
 
437 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  25.56 
 
 
437 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  32.14 
 
 
417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  26.57 
 
 
577 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  29.21 
 
 
452 aa  107  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  25.06 
 
 
437 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  29.95 
 
 
431 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  26.09 
 
 
408 aa  103  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  27.12 
 
 
447 aa  103  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  26.29 
 
 
424 aa  102  9e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1181  citrate transporter  30 
 
 
420 aa  102  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.355056 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  30.24 
 
 
433 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  26.33 
 
 
436 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  23.81 
 
 
428 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  29.41 
 
 
465 aa  99  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  26.72 
 
 
428 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  29.91 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  26.55 
 
 
421 aa  97.1  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  26.03 
 
 
421 aa  96.3  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>