More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0067 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
254 aa  507  1e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.35 
 
 
254 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.743418 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.31 
 
 
260 aa  290  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.45 
 
 
265 aa  256  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.5 
 
 
255 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
251 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
251 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
256 aa  175  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.36 
 
 
245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.92 
 
 
247 aa  172  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
262 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
250 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
265 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.96 
 
 
246 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.96 
 
 
248 aa  169  5e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2748  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  43.03 
 
 
250 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2737  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.75 
 
 
249 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
248 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000355798  normal  0.0941785 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.56 
 
 
246 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 
251 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2932  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.43 
 
 
250 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
252 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2840  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.43 
 
 
250 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.8 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  42.91 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
256 aa  166  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.36 
 
 
245 aa  165  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
302 aa  165  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.15 
 
 
245 aa  165  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.87 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.61 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.2 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
263 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
274 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1409  aldose dehydrogenase  40.16 
 
 
258 aa  162  7e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
249 aa  161  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0131  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
245 aa  161  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120855  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
257 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.15 
 
 
245 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
263 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
246 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.95 
 
 
245 aa  159  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
251 aa  159  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
258 aa  158  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
254 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
257 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
255 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
247 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
263 aa  157  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.31 
 
 
253 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
256 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0598  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.3 
 
 
247 aa  157  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
253 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.1 
 
 
248 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  38 
 
 
265 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
266 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.04 
 
 
250 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
257 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
257 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
275 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
257 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.96 
 
 
245 aa  156  3e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
262 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
249 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
269 aa  156  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 
258 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  40.8 
 
 
257 aa  156  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.69 
 
 
246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.63 
 
 
245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1344  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.11 
 
 
246 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.118162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
260 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.38 
 
 
248 aa  155  6e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
254 aa  155  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
252 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.65 
 
 
266 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2072  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.23 
 
 
247 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000027021  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
261 aa  155  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
254 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  39.04 
 
 
252 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.29 
 
 
246 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
262 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
267 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0904  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.57 
 
 
256 aa  153  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
255 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
261 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
271 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 
282 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 
282 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
257 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
247 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203668  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
255 aa  152  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.97 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0457  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.6 
 
 
242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.741091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>