More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0054 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0054  Chromate transporter  100 
 
 		 172 aa  322  1e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  34.34 
 
 		 173 aa  87.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  32.94 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  32.35 
 
 		 175 aa  84.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  35.8 
 
 		 177 aa  84  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  32.35 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  32.35 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  32.35 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  33.73 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  32.35 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  31.76 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0955  chromate transporter  45.59 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.457444  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  40.91 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  34.92 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  39.34 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  33.77 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  31.48 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  33.12 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  33.12 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  33.12 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  33.12 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  33.12 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  33.12 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  33.71 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  30.99 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  39.69 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  29.41 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  32.2 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  32.56 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  34.48 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  31.95 
 
 		 420 aa  68.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  29.24 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  42.02 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  35.48 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  30 
 
 		 416 aa  67.8  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  32.26 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  31.62 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  30.43 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  29.81 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  32.93 
 
 		 393 aa  64.3  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  38.84 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  29.81 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.17 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  35.87 
 
 		 408 aa  62.4  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  40.5 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  31.79 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  36.28 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  47.62 
 
 		 402 aa  62  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.41 
 
 		 407 aa  60.8  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  34.82 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  48.31 
 
 		 392 aa  60.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.82 
 
 		 387 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.82 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  40.37 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  45.88 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  40.82 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  43.33 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  43.33 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  40.82 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.82 
 
 		 405 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  40.82 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  49.41 
 
 		 407 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  31.21 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  47.19 
 
 		 392 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  45.88 
 
 		 401 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  39.76 
 
 		 409 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  40 
 
 		 403 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  36.67 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  28.99 
 
 		 450 aa  58.2  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  29.93 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  28.82 
 
 		 389 aa  57.8  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  28.92 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  40.74 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  40.74 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.78 
 
 		 415 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  26.51 
 
 		 493 aa  57  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  43.53 
 
 		 403 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  34.94 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  44.71 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.2 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  42.71 
 
 		 413 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  31.25 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.4 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.01 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.2 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  43.53 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  31.25 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  32.03 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  37.35 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  32.23 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  45.24 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0443  chromate transporter  31.25 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  39.51 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.47 
 
 		 395 aa  55.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  39.51 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  26.9 
 
 		 376 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2841  Chromate transporter  42.11 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000452935  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  39.51 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  28.07 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>