More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0053 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0053  Chromate transporter  100 
 
 
195 aa  380  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  39.77 
 
 
192 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  39.18 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  38.51 
 
 
198 aa  95.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  36.69 
 
 
190 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  34.88 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  36.9 
 
 
198 aa  87.8  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  33.72 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  34.71 
 
 
190 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  32.6 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  29.94 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  35.29 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  34.43 
 
 
428 aa  79.7  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  36.67 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  38.04 
 
 
191 aa  79  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  33.33 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  34.16 
 
 
203 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  31.55 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  34.16 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  34.16 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  37.59 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  34.38 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  34.76 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  33.12 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  38.69 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  37.18 
 
 
449 aa  72.4  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  30.98 
 
 
416 aa  72.4  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  33.57 
 
 
420 aa  72.4  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  33.56 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  27.68 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  25.75 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  28.57 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  29.41 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  33.71 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  29.75 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  35.54 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.81 
 
 
450 aa  68.6  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  31.65 
 
 
453 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  34.65 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  33.98 
 
 
154 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  34.68 
 
 
444 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  28.93 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  32.93 
 
 
431 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  30.99 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  34.13 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  31.06 
 
 
446 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0443  chromate transporter  36.96 
 
 
412 aa  65.5  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  27.22 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  33.51 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  36.36 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.88 
 
 
392 aa  65.1  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.15 
 
 
391 aa  65.1  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  40 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11551  chromate transporter  36.96 
 
 
412 aa  64.7  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0167365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  30.49 
 
 
456 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  32.78 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  32.77 
 
 
450 aa  64.7  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  29.73 
 
 
442 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  37.7 
 
 
174 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  31.71 
 
 
443 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  40.86 
 
 
430 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  28.93 
 
 
454 aa  63.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  28.93 
 
 
454 aa  63.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  29.32 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  32.97 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  30.22 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  33.33 
 
 
432 aa  62.8  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  31.93 
 
 
176 aa  62.8  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  29.71 
 
 
376 aa  62.8  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  33.93 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  29.5 
 
 
183 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  35.35 
 
 
454 aa  62.4  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.66 
 
 
468 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  33.86 
 
 
396 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  36.46 
 
 
453 aa  62.4  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  38.65 
 
 
201 aa  62  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  36.08 
 
 
213 aa  62  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  35.48 
 
 
398 aa  62  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  31.69 
 
 
204 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  29.63 
 
 
483 aa  62  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  31.78 
 
 
456 aa  61.6  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  30.16 
 
 
463 aa  61.6  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.77 
 
 
386 aa  61.6  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  34.23 
 
 
403 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.26 
 
 
447 aa  61.6  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.22 
 
 
405 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  29.28 
 
 
447 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4248  chromate transporter  37.29 
 
 
450 aa  61.2  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.01 
 
 
457 aa  61.2  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  29.94 
 
 
450 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.57 
 
 
472 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  36.99 
 
 
361 aa  60.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  29.27 
 
 
456 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1127  Chromate transporter  29 
 
 
153 aa  60.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  29.84 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.55 
 
 
465 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  32.67 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  31.85 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  33.33 
 
 
401 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  33.33 
 
 
401 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>