32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0050 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0050  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  283  8e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2491  PilT protein domain protein  54.74 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2011  PilT protein-like  42.14 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1166  PilT protein-like protein  40.5 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1570  PilT-like protein  31.21 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00584099  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3220  PilT domain-containing protein  34.56 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2532  PilT domain-containing protein  25 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127016  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1731  PilT domain-containing protein  26.81 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000308343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0176  hypothetical protein  29.2 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.185672  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1400  PilT protein domain protein  26.12 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000555482  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3405  PilT-like protein  32.09 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0278877  normal  0.0155111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2961  PilT protein domain protein  30.6 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.393791  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4271  PilT domain-containing protein  31.78 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0321554  normal  0.0832297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4435  hypothetical protein  32.35 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0434783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  28.06 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3973  PilT protein domain protein  32.12 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1854  PilT domain-containing protein  25.62 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2888  PIN domain protein  28.26 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0769801  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2508  PilT protein domain protein  28.26 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3611  PilT domain-containing protein  32.59 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235155  normal  0.0281309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0377  PilT protein domain protein  28.47 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0279891  normal  0.0333556 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1720  PilT protein-like  21.74 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1845  hypothetical protein  29.5 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1030  hypothetical protein  30.6 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0595  PilT domain-containing protein  22.7 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0580  PilT domain-containing protein  28.46 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0538  PilT protein-like  23.74 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4037  hypothetical protein  29.1 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1461  PilT-like protein  24.44 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2930  PIN domain protein  28.36 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0984  PilT protein-like  30.71 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4025  hypothetical protein  29.41 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>