181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0048 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0048  Appr-1-p processing domain-containing protein  100 
 
 
163 aa  319  9.000000000000001e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0052  Appr-1-p processing domain protein  69.81 
 
 
159 aa  220  7e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1745  Appr-1-p processing domain protein  51.92 
 
 
179 aa  140  8e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0998  appr-1-p processing domain-containing protein  43.37 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  41.18 
 
 
184 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3492  Appr-1-p processing domain protein  39.02 
 
 
179 aa  97.8  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  38.61 
 
 
164 aa  95.1  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  35.37 
 
 
173 aa  95.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4555  appr-1-p processing domain-containing protein  37.5 
 
 
173 aa  95.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  37.2 
 
 
177 aa  94.4  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  40.24 
 
 
183 aa  94  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1101  hypothetical protein  43.33 
 
 
220 aa  92  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  38.41 
 
 
177 aa  90.9  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0143  appr-1-p processing domain-containing protein  35.29 
 
 
184 aa  90.9  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.466073  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0394  Appr-1-p processing domain protein  43.66 
 
 
175 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0342747  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  38.41 
 
 
166 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  38.69 
 
 
172 aa  90.1  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1246  Appr-1-p processing domain protein  35.76 
 
 
176 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.07141  normal  0.0339932 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1293  hypothetical protein  43.18 
 
 
187 aa  90.1  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0201116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  43.88 
 
 
181 aa  89.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  38.18 
 
 
177 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11928  lipoprotein lppD  43.51 
 
 
358 aa  89  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0395522  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  36.9 
 
 
174 aa  88.6  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1797  Appr-1-p processing domain protein  39.16 
 
 
180 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  45.97 
 
 
172 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0194  hypothetical protein  40.35 
 
 
189 aa  88.6  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.45339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  39.39 
 
 
177 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0257  hypothetical protein  43.71 
 
 
196 aa  88.2  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.588012  normal  0.197055 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  30.12 
 
 
176 aa  87.4  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0695  Appr-1-p processing domain protein  41.13 
 
 
177 aa  87.4  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.701989  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0164  Appr-1-p processing domain protein  35.54 
 
 
173 aa  87.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.322732 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  37.06 
 
 
183 aa  87.4  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0206  hypothetical protein  42.58 
 
 
178 aa  87.4  8e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  34.52 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  37.14 
 
 
199 aa  86.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  37.5 
 
 
175 aa  87  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  43.17 
 
 
176 aa  85.5  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  37.21 
 
 
197 aa  85.5  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5311  Appr-1-p processing domain protein  34.94 
 
 
187 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503584  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  37.58 
 
 
177 aa  84.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  36.08 
 
 
175 aa  84  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  36.88 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  33.53 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  37.25 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  42.15 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1243  hypothetical protein  44.92 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188062  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  35.37 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  39.46 
 
 
599 aa  83.6  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0153  appr-1-p processing domain-containing protein  37.59 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1718  Appr-1-p processing domain protein  41.6 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.995476  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0314  appr-1-p processing domain-containing protein  37.58 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  41.22 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  38.78 
 
 
599 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  36.03 
 
 
195 aa  82  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1925  Appr-1-p processing domain protein  40.14 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000389838  unclonable  0.0000000101256 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16260  hypothetical protein  34.71 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0909717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0554  appr-1-p processing domain-containing protein  34.5 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  39.55 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  37.23 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  36.69 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  38.18 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  39.1 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  39.55 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  39.55 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  38.81 
 
 
179 aa  80.5  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  38.81 
 
 
179 aa  80.5  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  35.67 
 
 
180 aa  80.5  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5312  Appr-1-p processing domain protein  36.84 
 
 
694 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0633  appr-1-p processing domain-containing protein  36.2 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0075  appr-1-p processing domain-containing protein  35.4 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  33.13 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  37.65 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  34.5 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  40.85 
 
 
173 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  38.64 
 
 
181 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  33.81 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4619  Appr-1-p processing domain-containing protein  36.36 
 
 
224 aa  78.2  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0672354  hitchhiker  0.00245683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0694  hypothetical protein  45.76 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000693034 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3357  Appr-1-p processing domain protein  41.35 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3196  Appr-1-p processing domain protein  37.76 
 
 
165 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  36.14 
 
 
170 aa  77  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  34.31 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  42.5 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0557  Appr-1-p processing domain protein  41.67 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  34.91 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0191  Appr-1-p processing domain protein  31.33 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  38.76 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  34.15 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1928  Appr-1-p processing  35.43 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913427  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3571  Appr-1-p processing domain protein  41.18 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  35.1 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0121  Appr-1-p processing domain protein  38.85 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0869  Appr-1-p processing domain protein  33.77 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  33.74 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0064  Appr-1-p processing domain protein  36.3 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0212337  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  32.16 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  32.16 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1160  appr-1-p processing domain-containing protein  40.56 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.429654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  32.16 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>