More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0044 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
304 aa  602  1.0000000000000001e-171  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.31 
 
 
296 aa  462  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.603266  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 
318 aa  251  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.85 
 
 
314 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000137508  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.36 
 
 
415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.33288  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
417 aa  210  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.636087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
299 aa  209  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  41.36 
 
 
307 aa  209  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
307 aa  209  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
305 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
309 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.14 
 
 
306 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.75 
 
 
306 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
291 aa  199  6e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
353 aa  195  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  38.6 
 
 
288 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  36.68 
 
 
315 aa  195  9e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
296 aa  193  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
314 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000200699  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  39.93 
 
 
293 aa  192  8e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
293 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  43.6 
 
 
287 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  42.54 
 
 
294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.79 
 
 
293 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
317 aa  189  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  38.41 
 
 
321 aa  189  5e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
300 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.77 
 
 
317 aa  188  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.46 
 
 
307 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000296099  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
420 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.3 
 
 
310 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.38 
 
 
309 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
420 aa  186  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
312 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
300 aa  185  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
294 aa  185  9e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
310 aa  185  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1182  sugar ABC transporter, permease protein, putative  37.08 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547049  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1085  putative sugar ABC transporter, permease protein  37.08 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
320 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
306 aa  182  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
295 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0461  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.67 
 
 
301 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0176  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.54 
 
 
314 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
285 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168129  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.28 
 
 
314 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103465  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 
315 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0566553  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727517  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
316 aa  179  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1290  ABC transporter, permease protein  33.94 
 
 
311 aa  179  7e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.39 
 
 
318 aa  179  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000473727  hitchhiker  0.00124128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 
316 aa  178  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
305 aa  178  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00457854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1900  sugar ABC transporter, permease protein, putative  38.75 
 
 
314 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1635  sugar ABC transporter, permease  38.75 
 
 
314 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 
345 aa  178  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000672298  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0905  transmembrane permease MsmF  34.93 
 
 
289 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0122469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
429 aa  177  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.225919  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
328 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.913769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
313 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115668  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
292 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
313 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
308 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.283214  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  38.62 
 
 
293 aa  175  8e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000449996 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.06 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
318 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
306 aa  172  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0924232  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.97 
 
 
320 aa  172  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
315 aa  172  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0640497  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.95 
 
 
299 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3529  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
311 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
290 aa  170  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
318 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
314 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0166533  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.04 
 
 
328 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0926617  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
295 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2715  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.58 
 
 
350 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392142  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1529  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
318 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  0.149292 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
311 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
313 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  41.34 
 
 
354 aa  169  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
298 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
293 aa  169  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.548655  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
313 aa  169  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4638  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.41 
 
 
308 aa  168  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000461706  normal  0.23331 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
307 aa  168  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
307 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
310 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05100  permease component of ABC-type sugar transporter  36.07 
 
 
316 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
300 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.454536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>