14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0041 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0041  hypothetical protein  100 
 
 
570 aa  1140    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0676  hypothetical protein  29.74 
 
 
597 aa  229  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.11707  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0200  hypothetical protein  24.84 
 
 
432 aa  56.6  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.468077  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0150  hypothetical protein  28.74 
 
 
426 aa  57  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3674  hypothetical protein  31.2 
 
 
470 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0875618  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07307  DUF1237 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16720)  31.85 
 
 
523 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4291  hypothetical protein  25.12 
 
 
476 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0428  hypothetical protein  26.4 
 
 
427 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.397045  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28450  hypothetical protein  28.57 
 
 
457 aa  49.3  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.728185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0423  hypothetical protein  25.28 
 
 
427 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4029  hypothetical protein  26.15 
 
 
475 aa  47.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.500538  normal  0.302353 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1719  hypothetical protein  25.52 
 
 
427 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2716  hypothetical protein  24.27 
 
 
487 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0529181  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01628  hypothetical protein  27.09 
 
 
487 aa  43.5  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0543327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>