294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0038 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0038  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 302 aa  600  1.0000000000000001e-171  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  38.03 
 
 		 509 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  33 
 
 		 336 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0280  nosX protein  32.82 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  28.38 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  29.1 
 
 		 352 aa  93.6  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  33.33 
 
 		 331 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  25.6 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0051  ApbE family lipoprotein  29.47 
 
 		 255 aa  92.8  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.252526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  27.72 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  31.86 
 
 		 362 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  34.04 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  27.53 
 
 		 351 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  24.75 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  31.12 
 
 		 350 aa  90.5  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2356  ApbE family lipoprotein  32.06 
 
 		 332 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 		 344 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  31.19 
 
 		 365 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2856  ApbE family lipoprotein  31.41 
 
 		 330 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  28.37 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  31.68 
 
 		 368 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  29.33 
 
 		 333 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  25.17 
 
 		 337 aa  85.9  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0427  ApbE family lipoprotein  32.36 
 
 		 287 aa  85.5  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127952  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  31.23 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  27.52 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  27.65 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  23.93 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.52 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  28.52 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  26.35 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  23.84 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.87 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.93 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.1 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  26.42 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  32.03 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  27.61 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  30.88 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  30.11 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  25.58 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4214  ApbE family lipoprotein  33.47 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  28.79 
 
 		 339 aa  79  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  25.32 
 
 		 341 aa  79  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  31.88 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  28.86 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  26.95 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  26.69 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.52 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3962  ApbE family lipoprotein  31.83 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  0.0354055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6013  nitrous oxide reductase accessory protein NosX (required for nitrous oxide reduction), ApbE-like lipoprotein  29.25 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.279768  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  26.28 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  27.92 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.9 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  27.96 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  23.73 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  27.61 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  29.04 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  27.39 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  29.76 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  26 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  25.65 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  25.86 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  30.12 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  20.6 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  28.78 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0695  ApbE-like lipoprotein  26.01 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  29.45 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  23.4 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  30 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  28.04 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.38 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  28.78 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  26.62 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  27.01 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  28.62 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.52 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.52 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.4 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  25.22 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6589  ApbE family lipoprotein  30.07 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  29.37 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3168  ApbE family lipoprotein  33.77 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.4 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  28.14 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.35 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  23.25 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  25.18 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  29.1 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.2 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  25.6 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1971  ApbE family lipoprotein  22.46 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.196908 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  28.77 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  23.46 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  27.06 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.21 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>