More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0031 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 234 aa  447  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  82.43 
 
 		 222 aa  356  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  65.16 
 
 		 227 aa  271  6e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  59.66 
 
 		 241 aa  260  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2735  two component transcriptional regulator  58.93 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  58.74 
 
 		 229 aa  238  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4321  two component transcriptional regulator  57.64 
 
 		 248 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.16 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  56.71 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  54.2 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  54.2 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  54.2 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  53.91 
 
 		 256 aa  233  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.21 
 
 		 245 aa  231  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  54.35 
 
 		 245 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1014  two component transcriptional regulator  50.85 
 
 		 244 aa  231  8.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.22 
 
 		 249 aa  228  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  51.87 
 
 		 242 aa  223  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  56.52 
 
 		 250 aa  223  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.36 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000283527  decreased coverage  0.00121253 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  55.41 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.74 
 
 		 227 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.02 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05646  two-component response regulator transcription regulator protein  52.04 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6822  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5742  two component transcriptional regulator  52.42 
 
 		 342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0760421  hitchhiker  0.00137021 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3634  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 230 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.966844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4473  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 230 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3893  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 230 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3133  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.47 
 
 		 231 aa  214  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4359  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2118  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.78 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  48.44 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1497  two component transcriptional regulator  51.72 
 
 		 263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3084  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.67 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.692731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4211  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 219 aa  208  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4321  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 219 aa  208  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1954  two component transcriptional regulator  51.75 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.38 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 235 aa  204  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1493  two component transcriptional regulator  52.25 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.340507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.98 
 
 		 227 aa  201  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 231 aa  201  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 236 aa  201  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.68 
 
 		 237 aa  201  9e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0977  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.09 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  48.92 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3929  two component transcriptional regulator  51.75 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  48 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  45.66 
 
 		 227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.46 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4259  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1059  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 242 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.346912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1201  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  46.75 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106709  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  47.51 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0767733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1327  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  46.61 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1210  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  46.61 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000498147  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2689  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  47.56 
 
 		 240 aa  195  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3098  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  46.61 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BaeS  47.51 
 
 		 240 aa  194  9e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1577  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 240 aa  194  9e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01976  hypothetical protein  47.51 
 
 		 240 aa  194  9e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0981  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  47.51 
 
 		 240 aa  194  9e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.443633  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2221  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  47.51 
 
 		 240 aa  194  9e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1154  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  47.51 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2371  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  47.51 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1527  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1562  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  47.51 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.279171  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  45.66 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2707  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  46.32 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1573  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.59 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0360  two component signal transduction response regulator  45.74 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2368  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  46.61 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.531777  normal  0.413146 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2261  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  46.61 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.806239  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2477  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  46.61 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 248 aa  192  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2361  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  46.61 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  47.73 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2317  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  46.61 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3557  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  46.64 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3145  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00258001  hitchhiker  0.000377263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2228  two component transcriptional regulator  47.27 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00319429  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2872  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702853  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 232 aa  188  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 231 aa  187  8e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 234 aa  187  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  47.6 
 
 		 239 aa  187  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1307  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.97 
 
 		 242 aa  187  9e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0988  response regulator BaeR  41.36 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000405458  normal  0.303622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>