280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0023 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0023  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  189  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2884  hypothetical protein  57.65 
 
 
91 aa  101  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.4932  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2635  protein of unknown function DUF156  59.52 
 
 
82 aa  95.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.459536  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2676  hypothetical protein  55 
 
 
91 aa  87.8  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0819  hypothetical protein  58.62 
 
 
89 aa  72  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405513  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1900  protein of unknown function DUF156  44.59 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3027  hypothetical protein  48.65 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  41.18 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  41.18 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  45.12 
 
 
98 aa  67  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1624  protein of unknown function DUF156  39.73 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00315628  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  48.33 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3404  hypothetical protein  44.83 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  37.5 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  37.5 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0741  protein of unknown function DUF156  41.77 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000244551  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1069  protein of unknown function DUF156  42.31 
 
 
81 aa  64.7  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000553897  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0387  protein of unknown function DUF156  42.67 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.837751  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0533  hypothetical protein  45.83 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0395944  normal  0.0381301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0784  protein of unknown function DUF156  49.15 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.63261  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5881  hypothetical protein  42.31 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5191  protein of unknown function DUF156  49.37 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0909997  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4499  hypothetical protein  42.86 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.519747 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  42.86 
 
 
100 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  42.86 
 
 
100 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  36.84 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4587  hypothetical protein  40.66 
 
 
93 aa  63.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  42.86 
 
 
100 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  42.86 
 
 
100 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  42.86 
 
 
100 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  42.86 
 
 
100 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  42.86 
 
 
100 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  42.86 
 
 
100 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  42.86 
 
 
100 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  50.82 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19810  hypothetical protein  46.67 
 
 
119 aa  63.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.418046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3702  hypothetical protein  44.32 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  normal  0.0547705 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2278  hypothetical protein  41.25 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3786  hypothetical protein  50 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  49.12 
 
 
145 aa  62  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  49.18 
 
 
121 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1210  protein of unknown function DUF156  53.7 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  49.18 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  50 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  53.12 
 
 
91 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  40.74 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  43.66 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0673  hypothetical protein  51.67 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121389  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0461  hypothetical protein  41.46 
 
 
91 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000042131  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  45.45 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  48.39 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  44.44 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  44.07 
 
 
100 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3465  protein of unknown function DUF156  39.19 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0950133  normal  0.633622 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4045  hypothetical protein  52.46 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3257  protein of unknown function DUF156  49.15 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  54.24 
 
 
99 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1475  hypothetical protein  40.98 
 
 
88 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000574434  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2499  protein of unknown function DUF156  45.16 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  42.47 
 
 
103 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  42.47 
 
 
103 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9134  hypothetical protein  40.23 
 
 
93 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1739  protein of unknown function DUF156  36.26 
 
 
103 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0478748  hitchhiker  0.00498764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  42.47 
 
 
103 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  42.67 
 
 
91 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  56.86 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  40 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3676  protein of unknown function DUF156  47.37 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0410766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0017  hypothetical protein  48.39 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5648  protein of unknown function DUF156  43.24 
 
 
93 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3871  protein of unknown function DUF156  41.18 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00362908 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0120  hypothetical protein  48.44 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3443  protein of unknown function DUF156  35.11 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0992847  hitchhiker  0.00675708 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1650  hypothetical protein  49.12 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3133  protein of unknown function DUF156  40.48 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5706  hypothetical protein  50.98 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.840437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  51.56 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0484  hypothetical protein  40.79 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.082192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0466  protein of unknown function DUF156  38.55 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5303  hypothetical protein  50.98 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  40.48 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0676  hypothetical protein  43.33 
 
 
127 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0115732  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  38.57 
 
 
115 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3668  hypothetical protein  50.98 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531949  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3602  protein of unknown function DUF156  40.26 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.251846  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4106  hypothetical protein  45.21 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0298431  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  45.76 
 
 
101 aa  57.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1694  protein of unknown function DUF156  45 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.656008  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  42.65 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3295  hypothetical protein  36.14 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484311  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  38.96 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36760  hypothetical protein  45.16 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  45.16 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2404  protein of unknown function DUF156  35.23 
 
 
201 aa  57.4  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11794  hypothetical protein  40.62 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113188  hitchhiker  0.00000461883 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2051  protein of unknown function DUF156  41.94 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.44014e-26 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  40 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4017  hypothetical protein  38.67 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4092  hypothetical protein  38.67 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4247  hypothetical protein  38.67 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.0475693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>