48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0008 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 107 aa  203  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  43.4 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  40 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  40.95 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  34.58 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  45.1 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  41.28 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  39.25 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  38.2 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  38.46 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  32.32 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  39.39 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  38.2 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  40.78 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  40.7 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  36 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  38.2 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3607  branched-chain amino acid transport  34.02 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.459125  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  39.33 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  39.33 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0616  branched-chain amino acid transport  36 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441128  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  34 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1054  branched-chain amino acid transport  36 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416307  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1095  branched-chain amino acid transport  36 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000116861  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  31.33 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4072  integrase family protein  38.1 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0310  branched-chain amino acid transport  23.08 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  23.23 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4208  hypothetical protein  34.69 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000158916  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2853  hypothetical protein  29 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.438366  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  31.63 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1189  putative branched-chain amino acid transport protein  31.31 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  32.08 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0923  branched-chain amino acid transport  28.16 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.327368  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1690  hypothetical protein  31.91 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0542077  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1024  branched-chain amino acid transport  22.12 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0636348  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  30.39 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0159  hypothetical protein  31.07 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258263  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  37.37 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1743  hypothetical protein  31.4 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00109007  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1604  branched-chain amino acid transport  22.33 
 
 		 102 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0662  branched-chain amino acid transport  31.33 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00834286  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2350  branched-chain amino acid transport  31.58 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  29.41 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0319  branched-chain amino acid transport  29.79 
 
 		 106 aa  40  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000013452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>