260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0007 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  100 
 
 
246 aa  481  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  45.61 
 
 
240 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  41.23 
 
 
228 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  42.6 
 
 
234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  37.08 
 
 
240 aa  155  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  43.42 
 
 
258 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  37.61 
 
 
228 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  40.76 
 
 
244 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  38.68 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  36.33 
 
 
240 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  35.47 
 
 
242 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  40.09 
 
 
257 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  35.32 
 
 
235 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  35.32 
 
 
235 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  36.8 
 
 
235 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  32.2 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  35.09 
 
 
234 aa  135  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  41.63 
 
 
242 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  38.74 
 
 
234 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  40.16 
 
 
247 aa  131  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  41.3 
 
 
242 aa  131  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  41.99 
 
 
242 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  39.04 
 
 
233 aa  131  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  35.21 
 
 
238 aa  125  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  33.9 
 
 
255 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  33.9 
 
 
255 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  34.72 
 
 
293 aa  122  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  33.92 
 
 
241 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  36.6 
 
 
258 aa  121  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  34.04 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  33.78 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  35.62 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  34.91 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  32.17 
 
 
273 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  30.4 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  30.52 
 
 
273 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  30.86 
 
 
273 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  31.05 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  34.08 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  29.86 
 
 
242 aa  113  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  33.77 
 
 
252 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  31.6 
 
 
230 aa  112  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  37 
 
 
243 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  33.05 
 
 
247 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  29.57 
 
 
236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  31.67 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  34.83 
 
 
266 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  32.99 
 
 
240 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  35.56 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  34 
 
 
255 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  29.33 
 
 
247 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  30.83 
 
 
240 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  40.7 
 
 
239 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  38.1 
 
 
234 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  31.8 
 
 
276 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  28.44 
 
 
237 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  32.46 
 
 
232 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  34.36 
 
 
238 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  32.19 
 
 
251 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0568  hypothetical protein  32.79 
 
 
265 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  33.63 
 
 
242 aa  102  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  33.51 
 
 
246 aa  101  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  32.13 
 
 
272 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  28.82 
 
 
229 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  32.13 
 
 
272 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  35.83 
 
 
237 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  32.13 
 
 
251 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  30.51 
 
 
244 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  35.81 
 
 
255 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  35.78 
 
 
280 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  30.49 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  29.36 
 
 
241 aa  98.2  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  28.88 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  36.22 
 
 
240 aa  97.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  39.05 
 
 
217 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  30.48 
 
 
244 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0353  AzlC family protein  36.55 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.16576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  35.68 
 
 
243 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  30.46 
 
 
242 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  34.73 
 
 
292 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  35.39 
 
 
249 aa  95.9  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  33.33 
 
 
238 aa  95.5  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  24.89 
 
 
233 aa  95.5  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  35.78 
 
 
250 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03312  putative amino acid transporter  31.72 
 
 
240 aa  94  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0993  AzlC family protein  30.85 
 
 
249 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.486943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0831  AzlC family protein  30.85 
 
 
249 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  32.58 
 
 
235 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0835  AzlC family protein  30.85 
 
 
249 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327675  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0457  AzlC family protein  32.68 
 
 
251 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279448 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4637  AzlC-like  32.1 
 
 
255 aa  93.2  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621968  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2852  hypothetical protein  31.93 
 
 
236 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  36.63 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0661  AzlC family protein  30.35 
 
 
253 aa  93.2  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428637  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  33.04 
 
 
230 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  33.04 
 
 
230 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2677  AzlC family protein  31.56 
 
 
251 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0035  AzlC family protein  30.85 
 
 
249 aa  92  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  29.31 
 
 
247 aa  92  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0589  AzlC family protein  30.85 
 
 
249 aa  92  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>