147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0005 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  777    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  60.16 
 
 
382 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  33.17 
 
 
449 aa  192  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  33.95 
 
 
464 aa  189  8e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  32.84 
 
 
433 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  31.13 
 
 
449 aa  176  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  30.79 
 
 
430 aa  169  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  29.9 
 
 
410 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  28.75 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  30.85 
 
 
543 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  31.55 
 
 
348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  31.86 
 
 
348 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  31.86 
 
 
348 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  29.01 
 
 
607 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  31.63 
 
 
339 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  27.91 
 
 
570 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  28.42 
 
 
347 aa  100  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  31.65 
 
 
346 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  27.24 
 
 
571 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  28.42 
 
 
347 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  26.44 
 
 
565 aa  97.4  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  28.32 
 
 
542 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  27.63 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  30.09 
 
 
572 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  30.84 
 
 
345 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  29.65 
 
 
572 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  31.56 
 
 
342 aa  91.3  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  31.14 
 
 
338 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  29.01 
 
 
374 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  28.29 
 
 
410 aa  89.7  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  28 
 
 
547 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  32.13 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  30.89 
 
 
345 aa  86.7  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  24.38 
 
 
567 aa  86.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  27.3 
 
 
365 aa  86.7  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  29.33 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  30.8 
 
 
567 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  32.38 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  32.38 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  27.8 
 
 
551 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  30.37 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  29.6 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  30.74 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  26.21 
 
 
545 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  30.25 
 
 
526 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  27.82 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  29.57 
 
 
337 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  32.61 
 
 
336 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  28.91 
 
 
568 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  30.6 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  27.83 
 
 
476 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  26.22 
 
 
546 aa  80.1  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  29.07 
 
 
533 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  25.45 
 
 
601 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  28.89 
 
 
605 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  28.57 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  32.87 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  24.38 
 
 
568 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  27.33 
 
 
569 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  27.51 
 
 
600 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  27.07 
 
 
600 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  30.39 
 
 
320 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30.59 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  25.21 
 
 
298 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  27.76 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  24.58 
 
 
312 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  30.83 
 
 
330 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  24.62 
 
 
439 aa  63.2  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  27.98 
 
 
474 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0036  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 
514 aa  60.1  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83786  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  22.25 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  25.22 
 
 
330 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.54 
 
 
406 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.36 
 
 
382 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  22.19 
 
 
369 aa  56.6  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  33.06 
 
 
302 aa  56.6  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  29.78 
 
 
341 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  23.83 
 
 
278 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  31.14 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  27.67 
 
 
498 aa  53.5  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.49 
 
 
330 aa  53.5  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  28.24 
 
 
332 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  31.45 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2431  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  33.64 
 
 
735 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474543  normal  0.175702 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  20.81 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0869  carboxylic ester hydrolase; acetylhydrolase  26.21 
 
 
468 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.12 
 
 
426 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  26.56 
 
 
384 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0893  hypothetical protein  25.98 
 
 
468 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0950  hypothetical protein  25.98 
 
 
468 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4255  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30.46 
 
 
443 aa  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.4814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  26.24 
 
 
391 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1035  hypothetical protein  25.98 
 
 
468 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2349399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  30.83 
 
 
285 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  26.74 
 
 
339 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1038  hypothetical protein  26.47 
 
 
468 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.059236  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  23.77 
 
 
317 aa  48.5  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  22 
 
 
456 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  23.86 
 
 
319 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  26.32 
 
 
498 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>