More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0001 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  81.05 
 
 
439 aa  731  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
439 aa  900  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  1.09214e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  64.02 
 
 
470 aa  561  1e-159  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  51.45 
 
 
457 aa  468  1e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  50.43 
 
 
457 aa  468  1e-130  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.03 
 
 
443 aa  459  1e-128  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  49.89 
 
 
440 aa  454  1e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.18947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  50.56 
 
 
446 aa  452  1e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  50.56 
 
 
446 aa  452  1e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  50.34 
 
 
446 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  50.79 
 
 
446 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  49.1 
 
 
450 aa  448  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  50.34 
 
 
446 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  50.34 
 
 
446 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  50.34 
 
 
446 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  50.34 
 
 
446 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  49.89 
 
 
446 aa  445  1e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.45 
 
 
453 aa  446  1e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  50.11 
 
 
446 aa  447  1e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  49.32 
 
 
450 aa  445  1e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.58 
 
 
463 aa  446  1e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  51.24 
 
 
443 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  48.98 
 
 
446 aa  441  1e-122  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  49.22 
 
 
441 aa  441  1e-122  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  47.18 
 
 
443 aa  440  1e-122  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  50.11 
 
 
442 aa  440  1e-122  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.31 
 
 
454 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.3 
 
 
446 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.08181e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.03 
 
 
444 aa  432  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  50.36 
 
 
436 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.9 
 
 
454 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.31762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  47.42 
 
 
472 aa  417  1e-115  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68077e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  50.11 
 
 
445 aa  417  1e-115  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.7 
 
 
453 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  46.09 
 
 
478 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  3.39822e-05  hitchhiker  3.14878e-05 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  43.69 
 
 
449 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  46.33 
 
 
460 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  43.52 
 
 
460 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.2 
 
 
461 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  7.04659e-08  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.03 
 
 
449 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.41272e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  46.12 
 
 
452 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  44.01 
 
 
458 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.04436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  45.47 
 
 
480 aa  405  1e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  6.50471e-10 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  45.9 
 
 
482 aa  408  1e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.3 
 
 
456 aa  408  1e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  45.8 
 
 
481 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  5.6365e-07  unclonable  1.12062e-05 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  47.19 
 
 
453 aa  400  1e-110  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  44.54 
 
 
451 aa  400  1e-110  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  45.21 
 
 
460 aa  401  1e-110  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.43 
 
 
447 aa  397  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  44.99 
 
 
456 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.41 
 
 
458 aa  396  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  44.42 
 
 
453 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  44.42 
 
 
453 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  43.37 
 
 
450 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  44.56 
 
 
492 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
459 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  3.86226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  42.86 
 
 
445 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  42.57 
 
 
454 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  45.05 
 
 
453 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  44.82 
 
 
453 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.26 
 
 
509 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  43.89 
 
 
494 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  45.02 
 
 
450 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  3.22878e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  46.43 
 
 
495 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  46.43 
 
 
495 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  46.43 
 
 
495 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.76 
 
 
450 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  40.09 
 
 
490 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  42.89 
 
 
463 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  43.36 
 
 
455 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  43.6 
 
 
464 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  43.14 
 
 
466 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  43.41 
 
 
451 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  1.23931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  43.41 
 
 
451 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.58 
 
 
503 aa  372  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08301  chromosomal replication initiation protein  44.1 
 
 
463 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  40.96 
 
 
489 aa  365  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  8.45727e-09  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.38 
 
 
480 aa  368  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05911  chromosomal replication initiation protein  41.68 
 
 
464 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.35 
 
 
587 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  7.18914e-09  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.35 
 
 
591 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  2.92755e-08 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0886  chromosomal replication initiation protein  43.7 
 
 
462 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.51 
 
 
464 aa  365  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  42.14 
 
 
461 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  6.03983e-07 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  39.91 
 
 
492 aa  363  3e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10001  chromosomal replication initiation protein  45.51 
 
 
507 aa  363  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  53.59 
 
 
597 aa  363  4e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  2.78732e-07  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  43.32 
 
 
465 aa  362  6e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  43.63 
 
 
465 aa  362  7e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  44.98 
 
 
440 aa  362  8e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  43.17 
 
 
463 aa  362  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.17775e-05  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  43.13 
 
 
467 aa  361  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.26813e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.92 
 
 
480 aa  362  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.13 
 
 
467 aa  361  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.36922e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  43.13 
 
 
467 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  43.13 
 
 
467 aa  361  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.02031e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  43.13 
 
 
467 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  43.13 
 
 
467 aa  361  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.01887e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  43.13 
 
 
467 aa  361  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>