More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6417 on replicon NC_010517
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
196 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  90 
 
 
197 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  85.86 
 
 
198 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  67.22 
 
 
290 aa  241  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  66.11 
 
 
313 aa  236  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  64.44 
 
 
187 aa  223  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  62.43 
 
 
181 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  62.98 
 
 
181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4606  resolvase domain-containing protein  70.71 
 
 
140 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  55.25 
 
 
185 aa  191  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  55.25 
 
 
185 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  54.7 
 
 
185 aa  188  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  53.59 
 
 
185 aa  187  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  51.91 
 
 
183 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  53.33 
 
 
183 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  50 
 
 
184 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  46.77 
 
 
186 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  43.65 
 
 
185 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 
186 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 
186 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  46.15 
 
 
186 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  45.36 
 
 
189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  44.2 
 
 
190 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  42.78 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  44.69 
 
 
185 aa  138  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  44.2 
 
 
185 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  44.2 
 
 
205 aa  132  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  44.2 
 
 
205 aa  132  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  42.78 
 
 
188 aa  132  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  40.44 
 
 
183 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  40 
 
 
201 aa  129  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  39.36 
 
 
197 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  40.78 
 
 
188 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  41.53 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  40.78 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  38.89 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  40.22 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  40.32 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  41.11 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  40.84 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  43.72 
 
 
205 aa  124  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  41.01 
 
 
188 aa  124  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  42.25 
 
 
194 aa  124  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  40 
 
 
193 aa  124  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  40.88 
 
 
187 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 
185 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  41.11 
 
 
185 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  42.7 
 
 
180 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  42.7 
 
 
184 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  43.41 
 
 
219 aa  121  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  42.7 
 
 
185 aa  121  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  37.5 
 
 
192 aa  121  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  39.77 
 
 
188 aa  121  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  42.31 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  39.89 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  44.52 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  39.77 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  40.34 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  39.66 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  37.11 
 
 
196 aa  119  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  40.11 
 
 
198 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  39.11 
 
 
179 aa  118  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  36.65 
 
 
195 aa  117  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  39.25 
 
 
186 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  41.21 
 
 
181 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 
192 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  38.33 
 
 
196 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  40.76 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  37.11 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  37.11 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  40.2 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  37.7 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  37.7 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  38.86 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  36.6 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  36.13 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.7 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 
199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 
197 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 
197 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  39.87 
 
 
189 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  39.7 
 
 
196 aa  116  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  40.43 
 
 
189 aa  115  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  40.11 
 
 
182 aa  115  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 
187 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.8 
 
 
188 aa  115  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  37.99 
 
 
185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  37.99 
 
 
185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  42.68 
 
 
194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  38.78 
 
 
235 aa  114  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  40 
 
 
186 aa  114  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  40 
 
 
186 aa  114  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  40 
 
 
186 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  38.8 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  38.8 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  39.11 
 
 
181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  40.11 
 
 
186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  45.05 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>