More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6229 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
359 aa  727    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  71.59 
 
 
362 aa  519  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  71.82 
 
 
362 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  71.94 
 
 
362 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  65.57 
 
 
313 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  61.92 
 
 
314 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  64.26 
 
 
310 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  45.57 
 
 
316 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  45.51 
 
 
318 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  43.93 
 
 
321 aa  278  9e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  42.37 
 
 
330 aa  273  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  40.43 
 
 
329 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  42.67 
 
 
329 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  41.18 
 
 
342 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  40.52 
 
 
316 aa  235  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  36.5 
 
 
351 aa  209  8e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  33.81 
 
 
350 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  33.81 
 
 
350 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  33.81 
 
 
350 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  37.82 
 
 
330 aa  206  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  37.42 
 
 
302 aa  203  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  37.62 
 
 
318 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  34.99 
 
 
389 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  35.28 
 
 
337 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  36.25 
 
 
337 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.56 
 
 
311 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  36.23 
 
 
358 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  35.83 
 
 
337 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  46.04 
 
 
211 aa  192  7e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  38.91 
 
 
288 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  34.55 
 
 
408 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  35.31 
 
 
300 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  35.62 
 
 
399 aa  186  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  33.22 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
301 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  34.01 
 
 
426 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  30.56 
 
 
391 aa  165  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  26.86 
 
 
444 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  29.75 
 
 
384 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  29.58 
 
 
388 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  29.16 
 
 
382 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  29.16 
 
 
382 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  28.53 
 
 
394 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  29 
 
 
384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  27.25 
 
 
382 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  27.25 
 
 
382 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
352 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  29.6 
 
 
346 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.06 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
249 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  30.74 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  37.3 
 
 
243 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  27.71 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  28.99 
 
 
311 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  31.84 
 
 
338 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  30.59 
 
 
338 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  27.76 
 
 
513 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  29.39 
 
 
557 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  28.48 
 
 
326 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  28.4 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0278  cytochrome c oxidase, subunit II  30.9 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  normal  0.0449669 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  31.23 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  32.46 
 
 
381 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  32.21 
 
 
372 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  31.6 
 
 
525 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  27.83 
 
 
398 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  30.43 
 
 
532 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  32.21 
 
 
372 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  30.38 
 
 
271 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  28.23 
 
 
538 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  27.73 
 
 
385 aa  113  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  31.5 
 
 
532 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  26.57 
 
 
418 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  31.5 
 
 
532 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  26.57 
 
 
418 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 
525 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  26.88 
 
 
388 aa  112  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 
525 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 
517 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 
517 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 
525 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 
525 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 
517 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  26.57 
 
 
390 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  27.62 
 
 
544 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  32.17 
 
 
321 aa  112  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  27.92 
 
 
524 aa  112  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  31.63 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  29.32 
 
 
521 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  31.1 
 
 
531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  27.03 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  30.12 
 
 
273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  30.13 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  30.52 
 
 
276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  31.1 
 
 
532 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  33.2 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  28.8 
 
 
315 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  26.58 
 
 
518 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  29.1 
 
 
528 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  32.43 
 
 
272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>