53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6191 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  100 
 
 		 227 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1355  Urease accessory protein UreF  67.4 
 
 		 226 aa  275  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1195  urease accessory protein UreF  67.4 
 
 		 226 aa  272  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1134  Urease accessory protein UreF  68.28 
 
 		 226 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  50.66 
 
 		 223 aa  214  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  42.21 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  39.57 
 
 		 243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  36.82 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  29.69 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  28.95 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2716  urease accessory protein UreF  31.67 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  34.89 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  31.03 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  26.7 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  28.76 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  30.54 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1681  urease accessory protein UreF  27.48 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  31.14 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  31.56 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  35.96 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  36.09 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  29.87 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  29.87 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  22.07 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  25.33 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  23.01 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  23.01 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  25.11 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  29.09 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  32.75 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  28.63 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  21.15 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  32.31 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  22.32 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  27.78 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2064  Urease accessory protein UreF  32 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000168254  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  28.57 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  29.15 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  29.25 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  22.97 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  24.09 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  25.42 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  27.19 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  26.43 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  26.41 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  32.52 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  25.33 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  27.43 
 
 		 230 aa  42  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48625  predicted protein  27.32 
 
 		 666 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06573  conserved hypothetical protein  24.62 
 
 		 291 aa  42  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182291  normal  0.0690952 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  24.31 
 
 		 214 aa  41.6  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>