71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6150 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6150  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
77 aa  157  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  96.1 
 
 
77 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2802  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  75.32 
 
 
77 aa  127  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  75.68 
 
 
88 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  75.68 
 
 
88 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141555  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  77.14 
 
 
81 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814234  normal  0.164928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1479  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  68.83 
 
 
77 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  77.14 
 
 
81 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323948  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  77.14 
 
 
81 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394196  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1973  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  74.32 
 
 
81 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0677  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  70.13 
 
 
77 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6104  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  74.32 
 
 
81 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4883  putative ferredoxin  70.13 
 
 
77 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169548  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5012  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  72.97 
 
 
81 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5288  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  72.97 
 
 
81 aa  114  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.782627  normal  0.0624847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3162  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  71.62 
 
 
81 aa  114  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274063  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34920  putative ferredoxin  72.97 
 
 
81 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025951  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0206  ferredoxin, 4Fe-4S  72.97 
 
 
81 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.623695 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  72.97 
 
 
81 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4190  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  67.53 
 
 
77 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.806772  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  67.53 
 
 
77 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.969084  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  67.53 
 
 
77 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417972  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  58.97 
 
 
76 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4072  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  50.65 
 
 
80 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3521  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.7 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0064  adenylylsulfate reductase, beta subunit  46.94 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  34.29 
 
 
345 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0351  adenylylsulfate reductase, beta subunit  47.92 
 
 
160 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.480328  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0759  ferredoxin  45.83 
 
 
60 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000247622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30 
 
 
840 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.88 
 
 
507 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1188  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  40.38 
 
 
289 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.35 
 
 
370 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2283  adenylylsulfate reductase, beta subunit  42.86 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3321  ferredoxin family protein  37.5 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2058  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.19 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.23 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  34.62 
 
 
644 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0272  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0565502 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  35.38 
 
 
378 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  32.79 
 
 
590 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2223  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.71 
 
 
75 aa  42.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.454145 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.15 
 
 
314 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0736  ferredoxin  41.67 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0117  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.71 
 
 
318 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1241  ferredoxin family protein  38.1 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.251684  normal  0.0451259 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1031  iron-sulfur cluster-binding protein  42.86 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.125159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.29 
 
 
368 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2420  ferredoxin family protein  34.48 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.498162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0481  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  39.29 
 
 
507 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1441  ferredoxin family protein  32.31 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722291  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  39.29 
 
 
507 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1188  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.31 
 
 
214 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.54 
 
 
950 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.93778  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  40 
 
 
1299 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4270  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.1 
 
 
271 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.21 
 
 
1487 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0997  adenylylsulfate reductase, beta subunit  40.35 
 
 
144 aa  41.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000160425  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0440  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.83 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4012  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  34.72 
 
 
315 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2339  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.77 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2288  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  30.77 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.43 
 
 
369 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.682287  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1323  benzoyl-CoA oxygenase, component A  39.29 
 
 
417 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0285  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  42.59 
 
 
340 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0862622  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1709  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  38 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1576  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  33.9 
 
 
791 aa  40.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.51 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1706  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.13 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0314  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.82 
 
 
404 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>