More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6086 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 829 aa  1657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  42.26 
 
 		 829 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  42.73 
 
 		 821 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  39.67 
 
 		 833 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  42.36 
 
 		 819 aa  556  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  40.62 
 
 		 797 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  43.56 
 
 		 789 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  40.3 
 
 		 806 aa  552  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  41.38 
 
 		 806 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  40.35 
 
 		 810 aa  545  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  41.89 
 
 		 801 aa  538  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  39.9 
 
 		 808 aa  537  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  40.38 
 
 		 778 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  39.53 
 
 		 815 aa  530  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  39.12 
 
 		 828 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  40.3 
 
 		 810 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  44.51 
 
 		 769 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  44.32 
 
 		 745 aa  527  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  42.6 
 
 		 812 aa  523  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  40.2 
 
 		 808 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  39.85 
 
 		 810 aa  522  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  40.25 
 
 		 810 aa  522  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  42.18 
 
 		 753 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  39.19 
 
 		 817 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  42.69 
 
 		 729 aa  511  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  42.96 
 
 		 750 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  38.6 
 
 		 802 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  43.35 
 
 		 750 aa  504  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  39.14 
 
 		 797 aa  502  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  38.56 
 
 		 794 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  38.75 
 
 		 820 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  37.96 
 
 		 828 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  38.2 
 
 		 828 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  38.07 
 
 		 828 aa  492  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  39.87 
 
 		 831 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  37.22 
 
 		 863 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  43.44 
 
 		 723 aa  482  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  40.99 
 
 		 741 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  39.77 
 
 		 748 aa  485  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  40.99 
 
 		 736 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  40.99 
 
 		 736 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  42.57 
 
 		 744 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  41.16 
 
 		 753 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  42.42 
 
 		 744 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  41.16 
 
 		 737 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  42.8 
 
 		 771 aa  482  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  41.13 
 
 		 738 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  39.23 
 
 		 799 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  41.16 
 
 		 753 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  39.47 
 
 		 747 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  40.99 
 
 		 752 aa  482  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  39.06 
 
 		 791 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  38.78 
 
 		 717 aa  477  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  39.51 
 
 		 729 aa  478  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  39.44 
 
 		 703 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  38.66 
 
 		 799 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  39.33 
 
 		 747 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  38.53 
 
 		 822 aa  477  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  38.9 
 
 		 745 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  39.44 
 
 		 703 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  39.39 
 
 		 729 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  40.32 
 
 		 724 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  39.37 
 
 		 729 aa  476  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  38.94 
 
 		 791 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  41.75 
 
 		 745 aa  475  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  41.85 
 
 		 771 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  38.8 
 
 		 747 aa  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  38.67 
 
 		 747 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  38.8 
 
 		 747 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  39.01 
 
 		 779 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  39.4 
 
 		 714 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  36.74 
 
 		 740 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  37.99 
 
 		 735 aa  463  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  38.07 
 
 		 877 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  39.97 
 
 		 743 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  41.04 
 
 		 733 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  40.14 
 
 		 747 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  40.11 
 
 		 726 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  36.12 
 
 		 797 aa  458  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  37.87 
 
 		 747 aa  457  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  40.86 
 
 		 754 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  40.14 
 
 		 745 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  38.8 
 
 		 747 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  38.8 
 
 		 747 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  37.34 
 
 		 729 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  38.66 
 
 		 776 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  38.39 
 
 		 745 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  37.83 
 
 		 752 aa  456  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  39.66 
 
 		 721 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  39.14 
 
 		 734 aa  452  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  38.46 
 
 		 750 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  39.51 
 
 		 689 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  39.94 
 
 		 719 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  40.2 
 
 		 757 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  40.82 
 
 		 757 aa  445  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  38.87 
 
 		 754 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  38.87 
 
 		 754 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  38.58 
 
 		 750 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  38.87 
 
 		 754 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  40.86 
 
 		 717 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>