More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6080 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  100 
 
 
271 aa  528  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  79.18 
 
 
271 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  78.44 
 
 
271 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  66.17 
 
 
270 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3151  ABC transporter related  71.91 
 
 
271 aa  322  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  72.18 
 
 
271 aa  322  5e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  48.64 
 
 
266 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  49.81 
 
 
259 aa  223  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  53.39 
 
 
260 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  50.79 
 
 
259 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  52.44 
 
 
260 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  52.85 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  49.8 
 
 
260 aa  208  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  51.82 
 
 
260 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  42.41 
 
 
257 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  47.92 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  36.29 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  45.06 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  49.79 
 
 
253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2740  ABC transporter related  49.78 
 
 
264 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  48.77 
 
 
260 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 
258 aa  192  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 
258 aa  192  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  44.64 
 
 
536 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  51.1 
 
 
257 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  46.67 
 
 
254 aa  188  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  41.45 
 
 
490 aa  188  8e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  44.54 
 
 
419 aa  186  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  43.43 
 
 
268 aa  185  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  47.92 
 
 
264 aa  184  9e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  36.67 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  44.3 
 
 
414 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  37.3 
 
 
268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  42.92 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  40.51 
 
 
264 aa  182  6e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  39.38 
 
 
274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  43.21 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  44.64 
 
 
424 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  43.72 
 
 
260 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  36.29 
 
 
405 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  42.06 
 
 
255 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0491  ABC transporter component  45.92 
 
 
267 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1212  ABC transporter related  36.63 
 
 
253 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50330  iron(III)-siderophore ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 
255 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219188  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  40.37 
 
 
267 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  46.78 
 
 
255 aa  175  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  49.58 
 
 
315 aa  175  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  38.91 
 
 
268 aa  175  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  44.59 
 
 
266 aa  174  9e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  41.25 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  41.25 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  41.25 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  41.25 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  46.02 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  38.46 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  42.06 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  40.59 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.83 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  41.78 
 
 
271 aa  172  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  43.48 
 
 
267 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  39.25 
 
 
294 aa  172  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
258 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  41.57 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  41.78 
 
 
271 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  41.78 
 
 
271 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  41.78 
 
 
271 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  41.78 
 
 
271 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  41.78 
 
 
271 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  41.78 
 
 
271 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  46.03 
 
 
262 aa  171  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  41.78 
 
 
271 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  44 
 
 
268 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  41.78 
 
 
271 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  47.48 
 
 
251 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  44.98 
 
 
255 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 
264 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  41.83 
 
 
271 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  43.15 
 
 
260 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  41 
 
 
253 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  44.98 
 
 
255 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3769  ABC transporter related  42.8 
 
 
255 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187611 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.53 
 
 
251 aa  170  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  42.47 
 
 
256 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  38.67 
 
 
311 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  37.82 
 
 
269 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  39.04 
 
 
267 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  43.81 
 
 
255 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  40.53 
 
 
277 aa  168  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.83 
 
 
285 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  43.67 
 
 
255 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  44.25 
 
 
274 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  34.45 
 
 
266 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  47.14 
 
 
257 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0691  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.51 
 
 
265 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3343  ABC transporter for cobalamin/Fe3+-siderophores ATP-binding protein  37.45 
 
 
273 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  37.82 
 
 
269 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  41.53 
 
 
259 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  39.61 
 
 
270 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  42.5 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>