More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5999 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
181 aa  359  9e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  63.19 
 
 
183 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  62.43 
 
 
176 aa  221  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  47.34 
 
 
232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  45.22 
 
 
176 aa  148  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  45.22 
 
 
176 aa  148  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  42.94 
 
 
184 aa  148  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  47.22 
 
 
187 aa  143  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  49.64 
 
 
182 aa  142  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  49.64 
 
 
185 aa  141  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  48.59 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  45.27 
 
 
169 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  44.38 
 
 
225 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  50.38 
 
 
139 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  49.29 
 
 
159 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  47.92 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  44.1 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  40.99 
 
 
170 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  46.94 
 
 
189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  44.67 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  45.22 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  43.92 
 
 
174 aa  125  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  38.61 
 
 
209 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  44.06 
 
 
182 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  44.14 
 
 
179 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  45.07 
 
 
179 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  38.65 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  35.8 
 
 
191 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  47.26 
 
 
158 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  46.58 
 
 
158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  45.07 
 
 
155 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  41.13 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 
146 aa  108  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  42.25 
 
 
156 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  42.03 
 
 
158 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  43.26 
 
 
167 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  40.43 
 
 
160 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
144 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
179 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
144 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
144 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  42.03 
 
 
145 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  36.23 
 
 
144 aa  98.2  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  36.23 
 
 
147 aa  98.2  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  37.23 
 
 
146 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  34.04 
 
 
145 aa  95.5  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  40.58 
 
 
145 aa  95.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  40.58 
 
 
145 aa  94.4  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  40.58 
 
 
165 aa  94.4  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  40.58 
 
 
145 aa  92.8  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  39.86 
 
 
145 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 
145 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  39.86 
 
 
145 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  39.13 
 
 
161 aa  92  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  36.5 
 
 
144 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  42.45 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  36.5 
 
 
144 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
164 aa  87.8  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  38.35 
 
 
153 aa  84.7  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  40.58 
 
 
145 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  40.58 
 
 
145 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  40.58 
 
 
145 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  40.58 
 
 
145 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  40.58 
 
 
145 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  38.93 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  45.37 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  39.86 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4877  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  38.54 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  34.92 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  34.92 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  38.21 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  36.22 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  40.62 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  39.23 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  34.51 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  34.81 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  39.25 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  34.51 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  39.25 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  34.51 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 
161 aa  67.4  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  36.28 
 
 
129 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  36.28 
 
 
129 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  34.43 
 
 
160 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  34.43 
 
 
160 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  34.43 
 
 
160 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  34.43 
 
 
160 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  34.43 
 
 
160 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  34.43 
 
 
160 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  34.43 
 
 
160 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  38.94 
 
 
128 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  34.51 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>