101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5960 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
379 aa  758    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  52.22 
 
 
378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
394 aa  99.8  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
380 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
383 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
385 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  24.38 
 
 
370 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
405 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  24.21 
 
 
362 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  28.11 
 
 
370 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  23.95 
 
 
362 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  23.95 
 
 
362 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  28.23 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  22.01 
 
 
369 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
369 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
378 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 
391 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  21.84 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
374 aa  88.6  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
398 aa  87  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  25.07 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  26.78 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  28.37 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  25.07 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  23.54 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  23.12 
 
 
405 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  33.48 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
367 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  26.12 
 
 
392 aa  77  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  24.21 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  25.94 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  22.75 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  27.04 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  24.01 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  23.75 
 
 
363 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  23.75 
 
 
363 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  26.65 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  30.71 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  21.82 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  24.23 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  25.72 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  29.33 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  28.98 
 
 
392 aa  67  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  22.97 
 
 
379 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  28.35 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  25.07 
 
 
388 aa  66.2  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  43.01 
 
 
207 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  52.24 
 
 
188 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 
417 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 
417 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  30.4 
 
 
375 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  23.77 
 
 
377 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
367 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  26.43 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  27.44 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  39.25 
 
 
229 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  36.36 
 
 
275 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
416 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  32.44 
 
 
381 aa  59.7  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
187 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
191 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 
191 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  26.03 
 
 
374 aa  56.2  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
586 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  25.2 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
378 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  31.09 
 
 
568 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
313 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  23.1 
 
 
367 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  31.03 
 
 
578 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  24.77 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  24.59 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  36.54 
 
 
370 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  24.93 
 
 
394 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
227 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
385 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
588 aa  50.4  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  32.75 
 
 
388 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  32.02 
 
 
388 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  29.26 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  29.8 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
329 aa  47.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  22.96 
 
 
339 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0531  transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 
529 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.614613  normal  0.848046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  26.67 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  34.67 
 
 
213 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  28.71 
 
 
362 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  34.67 
 
 
213 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
377 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 
368 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0081  regulatory protein, LuxR  43.14 
 
 
589 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318865  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  36.99 
 
 
360 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2939  regulatory protein LuxR  29.73 
 
 
128 aa  43.1  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>