More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5937 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7360  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  65.46 
 
 
691 aa  867    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0699  putative prolyl oligopeptidase  57.96 
 
 
688 aa  751    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593093  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  64.35 
 
 
691 aa  828    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5937  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
696 aa  1365    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.06347 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27550  serine protease, S9A family peptidase  46.21 
 
 
684 aa  565  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143413  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5550  prolyl oligopeptidase  47.18 
 
 
685 aa  565  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11141  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0127  prolyl oligopeptidase  44.93 
 
 
681 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268487  normal  0.664809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3481  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  43.59 
 
 
698 aa  560  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.452297 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04132  prolyl oligopeptidase family protein  44.62 
 
 
697 aa  553  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10470  serine protease, S9A family peptidase  44.89 
 
 
695 aa  550  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.447718  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4802  Prolyl oligopeptidase  42.61 
 
 
697 aa  547  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1575  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  45.19 
 
 
689 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.416  hitchhiker  0.0027772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0623  prolyl oligopeptidase  45.6 
 
 
663 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0636  prolyl oligopeptidase  45.6 
 
 
663 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0616  prolyl oligopeptidase  45.6 
 
 
663 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0785  prolyl oligopeptidase  44.33 
 
 
676 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10464  peptidase  44.54 
 
 
673 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1717  Prolyl oligopeptidase  41.79 
 
 
711 aa  528  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3695  Prolyl oligopeptidase  44.61 
 
 
711 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0734  Prolyl oligopeptidase  43.76 
 
 
681 aa  511  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  40.51 
 
 
696 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3675  Prolyl oligopeptidase  41.85 
 
 
676 aa  503  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169529  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2406  Prolyl oligopeptidase  42.38 
 
 
741 aa  492  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0714975  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3948  prolyl oligopeptidase  44.3 
 
 
702 aa  482  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08100  serine protease, S9A family peptidase  40.85 
 
 
718 aa  473  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.64586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0822  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.11 
 
 
767 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.67 
 
 
770 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  37.04 
 
 
696 aa  445  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  35.04 
 
 
695 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2612  Prolyl oligopeptidase  41.25 
 
 
699 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.270584 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  35.2 
 
 
710 aa  432  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  35.56 
 
 
697 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0018  prolyl oligopeptidase  38.33 
 
 
734 aa  431  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1083  prolyl oligopeptidase family protein  40.03 
 
 
748 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166772  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4870  prolyl oligopeptidase  38.6 
 
 
722 aa  428  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  35.44 
 
 
697 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  35.59 
 
 
697 aa  428  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5455  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  40.95 
 
 
704 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5931  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  42.34 
 
 
721 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  41.86 
 
 
707 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2164  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  41.96 
 
 
702 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.876944  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2146  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.34 
 
 
721 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466085  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1125  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.08 
 
 
721 aa  426  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00651092  normal  0.350875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2056  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  41.57 
 
 
703 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.273173  normal  0.9211 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35 
 
 
697 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  34.41 
 
 
701 aa  422  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  34.61 
 
 
697 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  34.12 
 
 
697 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2255  prolyl oligopeptidase  33.97 
 
 
697 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000270623  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0927  prolyl oligopeptidase family protein  39.39 
 
 
732 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0367  prolyl oligopeptidase family protein  39.39 
 
 
782 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2372  prolyl oligopeptidase  34.36 
 
 
697 aa  416  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000969986  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0454  prolyl oligopeptidase family protein  39.39 
 
 
698 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0193  prolyl oligopeptidase family protein  39.39 
 
 
772 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1911  serine protease  39.42 
 
 
776 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1824  prolyl oligopeptidase family protein  39.39 
 
 
776 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1414  prolyl oligopeptidase family protein  39.39 
 
 
698 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46548  predicted protein  36.33 
 
 
793 aa  407  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.560157  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1525  prolyl oligopeptidase family protein  39.97 
 
 
694 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466095  normal  0.0843483 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0527  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.99 
 
 
712 aa  399  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1218  Prolyl oligopeptidase  36.61 
 
 
680 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000231766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1073  Prolyl oligopeptidase  36.1 
 
 
680 aa  346  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594316  decreased coverage  0.00000514493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  27.94 
 
 
689 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  24.79 
 
 
719 aa  188  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  28.65 
 
 
710 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  37.97 
 
 
704 aa  179  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  34.52 
 
 
690 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  38.46 
 
 
723 aa  178  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  31.81 
 
 
1283 aa  177  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  31.54 
 
 
689 aa  177  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  31.9 
 
 
688 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  25.49 
 
 
703 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  24.89 
 
 
700 aa  174  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  26.61 
 
 
701 aa  173  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  24.61 
 
 
688 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  24.61 
 
 
688 aa  172  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  30.77 
 
 
707 aa  171  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  37.74 
 
 
726 aa  170  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  34.03 
 
 
670 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  38.11 
 
 
714 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1129  Prolyl oligopeptidase  40.09 
 
 
614 aa  169  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.107697  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  39.26 
 
 
692 aa  169  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  27.38 
 
 
719 aa  169  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  26.15 
 
 
695 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  40.56 
 
 
711 aa  168  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  39.07 
 
 
709 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  25.78 
 
 
685 aa  168  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  26.58 
 
 
677 aa  167  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  35.8 
 
 
703 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  35.78 
 
 
705 aa  167  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  26.87 
 
 
724 aa  167  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  34.34 
 
 
685 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  32.77 
 
 
745 aa  165  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  42.17 
 
 
666 aa  165  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  30.65 
 
 
703 aa  163  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.63 
 
 
740 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  33.04 
 
 
679 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  26.41 
 
 
723 aa  161  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  35.77 
 
 
730 aa  162  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  33.12 
 
 
708 aa  160  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>