54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5926 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  81.48 
 
 
189 aa  295  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  51.55 
 
 
174 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  46.06 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  44.38 
 
 
153 aa  117  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  39.62 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  38.85 
 
 
162 aa  96.3  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  37.82 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  38.61 
 
 
165 aa  84.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  38.31 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  36.54 
 
 
151 aa  77  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  39.24 
 
 
165 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  36.36 
 
 
153 aa  72  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  33.33 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  32.43 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  32.05 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  32.9 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  33.13 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1356  hypothetical protein  34.16 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  39.64 
 
 
206 aa  63.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  34.78 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  31.94 
 
 
160 aa  61.6  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  31.06 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  32.85 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  29.49 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  34.01 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  31.48 
 
 
177 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  33.83 
 
 
190 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  31.39 
 
 
144 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  33.82 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  32.24 
 
 
176 aa  55.1  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  27.04 
 
 
158 aa  54.7  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  33.04 
 
 
146 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  32 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  32 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2930  MOSC domain containing protein  33.91 
 
 
143 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1355  MOSC domain containing protein  33.91 
 
 
143 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0782676  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  32 
 
 
148 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0061  MOSC domain-containing protein  26.59 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.489415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2483  hypothetical protein  30.63 
 
 
179 aa  48.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0431097  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  32.26 
 
 
149 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1266  MOSC domain containing protein  28.47 
 
 
154 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.509209  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  31.01 
 
 
184 aa  45.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  31.1 
 
 
178 aa  45.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2271  MOSC domain containing protein  28.68 
 
 
143 aa  44.7  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  27.98 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1952  MOSC domain containing protein  28.68 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0259  MOSC domain containing protein  30.28 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.215992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2352  MOSC domain containing protein  32.11 
 
 
216 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  28.66 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0430  MOSC domain-containing protein  29.75 
 
 
151 aa  42.4  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.458415 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0779  MOSC domain-containing protein  31.76 
 
 
209 aa  42  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.161048  normal  0.0150919 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0414  MOSC domain-containing protein  28.45 
 
 
144 aa  41.6  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1967  hypothetical protein  25 
 
 
153 aa  41.2  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>