40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5923 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
137 aa  278  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  45 
 
 
132 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  41.18 
 
 
137 aa  100  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2467  hypothetical protein  38.93 
 
 
134 aa  99  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  50.52 
 
 
129 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3066  thioesterase superfamily protein  41.8 
 
 
131 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.22535e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  38.58 
 
 
130 aa  94.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  38.58 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  50 
 
 
136 aa  90.9  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1742  thioesterase superfamily protein  39.67 
 
 
131 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0155  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 
142 aa  87  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  41.13 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  42.86 
 
 
142 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  41.05 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1187  hypothetical protein  37.4 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.238156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1367  hypothetical protein  42.86 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.412504  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0696  dihydrolipoamide acyltransferase  37.14 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  41.67 
 
 
130 aa  76.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  37.82 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2310  conserved hypothetical protein  40.51 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1291  hypothetical protein  35.77 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  38 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1506  thioesterase  38.83 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1847  thioesterase superfamily protein  47.57 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2323  hypothetical protein  34.11 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  32.58 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  29.29 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1320  thioesterase  31.88 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.262542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7731  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  34.62 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3033  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1708  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850113  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0552  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000347456  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1901  thioesterase-like protein  30.3 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1520  thioesterase superfamily protein  28.72 
 
 
133 aa  51.2  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3259  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3050  hypothetical protein  30.68 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97623  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2156  thioesterase-like protein  32.35 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0874  thioesterase-like protein  21.77 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00486903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>