286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5816 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  100 
 
 
344 aa  662    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  51.8 
 
 
339 aa  279  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1815  urea amidolyase related protein  51.15 
 
 
339 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1105  urea amidolyase related protein  49.71 
 
 
339 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0170901  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1495  urea amidolyase related protein  49.85 
 
 
344 aa  257  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0419081  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2133  urea amidolyase related protein  49.71 
 
 
359 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  46.09 
 
 
349 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1708  urea amidolyase related protein  51.22 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0203426  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1505  allophanate hydrolase subunit 2  47.37 
 
 
353 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  41.75 
 
 
334 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  45.27 
 
 
336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2623  allophanate hydrolase subunit 2  47.75 
 
 
334 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  46.39 
 
 
335 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  41.25 
 
 
343 aa  229  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  42.46 
 
 
365 aa  227  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  46.54 
 
 
335 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1502  allophanate hydrolase subunit 2  44.97 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2041  allophanate hydrolase subunit 2  47.9 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3142  urea amidolyase related protein  43.55 
 
 
347 aa  219  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  43.32 
 
 
389 aa  219  7.999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3354  urea amidolyase related protein  49.41 
 
 
338 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  42.96 
 
 
353 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1384  urea amidolyase related protein  45.18 
 
 
338 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.669414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  44.97 
 
 
315 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  37.58 
 
 
322 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  39.6 
 
 
328 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  40.53 
 
 
309 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  40.26 
 
 
323 aa  205  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  42.18 
 
 
354 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3431  urea amidolyase related protein  45.83 
 
 
354 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782609  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  41.89 
 
 
354 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  38.94 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1902  hypothetical protein  36.45 
 
 
321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0520  urea amidolyase related protein  43.57 
 
 
350 aa  199  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  41.96 
 
 
355 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  39.38 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  44.79 
 
 
286 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  39.06 
 
 
309 aa  193  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  36.89 
 
 
329 aa  192  7e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  37.25 
 
 
307 aa  192  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  41.12 
 
 
330 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1714  hypothetical protein  36.36 
 
 
321 aa  191  1e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.768443  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1528  hypothetical protein  36.36 
 
 
321 aa  192  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  39.09 
 
 
314 aa  189  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3875  urea amidolyase related protein  40 
 
 
305 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377031  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  36.83 
 
 
350 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  38.76 
 
 
314 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  38.7 
 
 
310 aa  186  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  39.32 
 
 
312 aa  186  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  38.41 
 
 
311 aa  186  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  36.83 
 
 
350 aa  186  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1977  urea amidolyase related protein  41.46 
 
 
320 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0301643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  40.99 
 
 
323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  41.42 
 
 
353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  36.86 
 
 
306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  32.69 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  40.68 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  38.51 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  38.51 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1665  hypothetical protein  34.69 
 
 
336 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  35.27 
 
 
334 aa  184  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  39.08 
 
 
324 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1699  hypothetical protein  34.69 
 
 
336 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4096  urea amidolyase related protein  40.82 
 
 
305 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  40.68 
 
 
323 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  35.78 
 
 
350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  31.6 
 
 
329 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  32.52 
 
 
329 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  36.89 
 
 
355 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  36.89 
 
 
355 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  36.89 
 
 
355 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  34.05 
 
 
329 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2804  allophanate hydrolase subunit 2  38.69 
 
 
330 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.776372 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  38.13 
 
 
309 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  39.24 
 
 
324 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  31.9 
 
 
329 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  38.1 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  44.56 
 
 
308 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  38.1 
 
 
316 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  38.61 
 
 
317 aa  179  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  37.13 
 
 
359 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  37.13 
 
 
359 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  37.13 
 
 
359 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  37.13 
 
 
371 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  37.13 
 
 
371 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  37.13 
 
 
371 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  37.13 
 
 
371 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  31.6 
 
 
329 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  39.51 
 
 
339 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.76 
 
 
316 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1407  allophanate hydrolase subunit 2  41.32 
 
 
304 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  36.81 
 
 
356 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4575  urea amidolyase related protein  40.43 
 
 
305 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  32.69 
 
 
320 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  32.69 
 
 
320 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  40.77 
 
 
290 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  36.61 
 
 
356 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  30.98 
 
 
329 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  36.66 
 
 
359 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  32.7 
 
 
329 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>