More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5432 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  100 
 
 		 553 aa  1097    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  72.83 
 
 		 463 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  72.28 
 
 		 518 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  70.38 
 
 		 497 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  70.22 
 
 		 488 aa  524  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  70.38 
 
 		 488 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  55.31 
 
 		 478 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  55.04 
 
 		 480 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  55.71 
 
 		 489 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  53.12 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  54.52 
 
 		 464 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  51.3 
 
 		 460 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  53.42 
 
 		 522 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  54.82 
 
 		 483 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  55.34 
 
 		 463 aa  375  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  52.05 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  51.23 
 
 		 490 aa  371  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  51.5 
 
 		 487 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  45.6 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  45.56 
 
 		 456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  46.52 
 
 		 472 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  45.99 
 
 		 469 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  45.53 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  42.86 
 
 		 472 aa  295  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  44.39 
 
 		 461 aa  294  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  44.08 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  45.15 
 
 		 452 aa  282  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  43.85 
 
 		 472 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  44.88 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  41.78 
 
 		 464 aa  273  9e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  41.78 
 
 		 538 aa  249  7e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1781  TolC family type I secretion outer membrane protein  39.83 
 
 		 517 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0863506  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.28 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.43 
 
 		 497 aa  202  9e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.87 
 
 		 497 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  37.39 
 
 		 456 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1003  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.97 
 
 		 462 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.97 
 
 		 494 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.64 
 
 		 462 aa  180  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.72 
 
 		 405 aa  178  3e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.14 
 
 		 485 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  34.82 
 
 		 466 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.24 
 
 		 497 aa  163  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.82 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1991  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.62 
 
 		 473 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.533391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.08 
 
 		 465 aa  156  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3542  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.03 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.75 
 
 		 562 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1020  putative outer membrane protein TolC  30.23 
 
 		 423 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.808388  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0823  Outer membrane efflux protein  29.85 
 
 		 432 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0383439  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1445  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.54 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.40462 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2727  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.37 
 
 		 464 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2597  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.49 
 
 		 492 aa  131  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.86 
 
 		 449 aa  123  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.47 
 
 		 444 aa  119  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.5 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4823  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.9 
 
 		 446 aa  110  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  27.12 
 
 		 425 aa  106  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  25.98 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  24.78 
 
 		 436 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.33 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.89 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  25.85 
 
 		 436 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.87 
 
 		 501 aa  99  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1293  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  27.25 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.48 
 
 		 472 aa  98.2  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.68 
 
 		 457 aa  98.2  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.68 
 
 		 456 aa  97.8  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  25.86 
 
 		 445 aa  97.1  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.3 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.46 
 
 		 524 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.32 
 
 		 475 aa  95.5  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.2 
 
 		 471 aa  94.7  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  29.39 
 
 		 470 aa  94.4  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  26.84 
 
 		 481 aa  94  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.93 
 
 		 471 aa  94  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.93 
 
 		 471 aa  94  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.96 
 
 		 459 aa  94  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.13 
 
 		 450 aa  93.6  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.08 
 
 		 475 aa  93.6  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  23.06 
 
 		 471 aa  93.6  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.83 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.65 
 
 		 471 aa  92  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.85 
 
 		 441 aa  92.4  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1875  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.18 
 
 		 476 aa  92.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  27.04 
 
 		 477 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1277  outer membrane protein TolC, putative  26.8 
 
 		 479 aa  92  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271455  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.62 
 
 		 473 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.62 
 
 		 473 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.75 
 
 		 445 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2659  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.89 
 
 		 451 aa  90.9  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  23.19 
 
 		 469 aa  91.3  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.23 
 
 		 455 aa  90.9  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.62 
 
 		 472 aa  90.5  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  24.86 
 
 		 440 aa  90.5  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  25.35 
 
 		 574 aa  90.1  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  25.07 
 
 		 574 aa  89  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.61 
 
 		 519 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.53 
 
 		 450 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.7 
 
 		 466 aa  88.6  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>