129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5286 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  283  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  40.65 
 
 
140 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  38.46 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  38.74 
 
 
151 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  37.98 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  38.02 
 
 
139 aa  90.1  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  35.9 
 
 
144 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  38.02 
 
 
148 aa  87  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  37.98 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  38.79 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  32.59 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  36.45 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  37.04 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  31.67 
 
 
145 aa  76.6  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  34.38 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  38.46 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  34.43 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  34.43 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  31.45 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  33.87 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  33.87 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  32.31 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  31.11 
 
 
157 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  33.57 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  33.07 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  30.08 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  28.79 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  30.47 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  33.61 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  32.81 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  34.23 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  30.63 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  31.58 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2718  protein of unknown function DUF1486  30.56 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000849743  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  29.32 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4924  hypothetical protein  35.97 
 
 
155 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.07 
 
 
316 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  28.33 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  28.03 
 
 
185 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  28.03 
 
 
185 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  29.69 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  29.46 
 
 
179 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  28.33 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  27.69 
 
 
182 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  27.91 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3371  hypothetical protein  28.57 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.032421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  27.91 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  25 
 
 
186 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  26.67 
 
 
182 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  26.67 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  25 
 
 
185 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  26.67 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  26.67 
 
 
182 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  26.4 
 
 
138 aa  57.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  24.24 
 
 
185 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  27.91 
 
 
179 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  26.67 
 
 
182 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  26.67 
 
 
179 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  27.48 
 
 
186 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  24.8 
 
 
284 aa  57  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0317  protein of unknown function DUF1486  35.25 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478711 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  24.65 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  24.65 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  24.65 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  24.65 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  24.65 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  24.65 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  24.65 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3746  hypothetical protein  24.22 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 
402 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5713  protein of unknown function DUF1486  34.07 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  28.97 
 
 
180 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  26.36 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  29.85 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  25.2 
 
 
181 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4917  hypothetical protein  35.25 
 
 
149 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5449  hypothetical protein  32.67 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4298  hypothetical protein  28.79 
 
 
392 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.304532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  28.03 
 
 
146 aa  52  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  29.82 
 
 
174 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  29.82 
 
 
174 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  26.73 
 
 
176 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  29.57 
 
 
175 aa  50.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  31.03 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0524  hypothetical protein  31.51 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2585  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000118925  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0972  hypothetical protein  27.78 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.284776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  28.95 
 
 
174 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0034  protein of unknown function DUF1486  29.06 
 
 
219 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  27.86 
 
 
173 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  33.75 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0036  protein of unknown function DUF1486  29.06 
 
 
219 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  31.65 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  31.25 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  25.78 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3104  hypothetical protein  31.71 
 
 
85 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0633963  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2034  protein of unknown function DUF1486  29.57 
 
 
135 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0819  hypothetical protein  30.26 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1108  hypothetical protein  26.98 
 
 
329 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.786655  normal  0.15681 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>