More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5280 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  100 
 
 
359 aa  730  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  68.7 
 
 
361 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  44.81 
 
 
367 aa  283  5e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.78626e-15  hitchhiker  6.08481e-12 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  41.83 
 
 
407 aa  239  6e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  36.74 
 
 
363 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  37.14 
 
 
600 aa  200  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  35.41 
 
 
410 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  37.46 
 
 
380 aa  192  7e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  36.8 
 
 
866 aa  190  3e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  36.81 
 
 
420 aa  190  3e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.87 
 
 
411 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  38.4 
 
 
369 aa  186  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54983  predicted protein  32.56 
 
 
891 aa  184  2e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01006  Nitrate reductase [NADPH] (NR)(EC 1.7.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22945]  34.95 
 
 
873 aa  184  2e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.88 
 
 
453 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  33.6 
 
 
457 aa  175  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  37.25 
 
 
370 aa  173  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  36.29 
 
 
372 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.81 
 
 
417 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  31.04 
 
 
461 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 
461 aa  170  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.81 
 
 
412 aa  169  6e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.81 
 
 
412 aa  169  6e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  37.57 
 
 
414 aa  167  3e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  37.18 
 
 
369 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  35.84 
 
 
369 aa  164  2e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.24 
 
 
415 aa  164  2e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.98483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.27 
 
 
416 aa  161  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  36.19 
 
 
402 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  33.6 
 
 
414 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  36.19 
 
 
403 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  32.8 
 
 
408 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.63 
 
 
408 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  34.78 
 
 
369 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  35.18 
 
 
401 aa  156  5e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  32.07 
 
 
408 aa  156  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  34.37 
 
 
406 aa  156  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  31.3 
 
 
451 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  31.88 
 
 
408 aa  155  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18836e-05 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  35.05 
 
 
426 aa  153  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  38.17 
 
 
376 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.1 
 
 
408 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  5.59992e-07 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  33.98 
 
 
405 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  33.98 
 
 
405 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  29.43 
 
 
1016 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  30.58 
 
 
412 aa  151  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.11038e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  33.61 
 
 
402 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  31.83 
 
 
408 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  33.99 
 
 
446 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  34.64 
 
 
401 aa  147  2e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.7 
 
 
416 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.33 
 
 
400 aa  146  7e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.5 
 
 
415 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  32.31 
 
 
403 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.06 
 
 
412 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  36.42 
 
 
428 aa  143  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  5.38057e-06 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  36.42 
 
 
428 aa  143  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  34.84 
 
 
407 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  32.6 
 
 
410 aa  141  2e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.96 
 
 
417 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3554  predicted protein  30.26 
 
 
375 aa  137  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298587  normal  0.425378 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  34.17 
 
 
431 aa  136  6e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  35.26 
 
 
434 aa  135  1e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  28.65 
 
 
414 aa  133  4e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  28.61 
 
 
409 aa  133  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.47 
 
 
400 aa  132  8e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  32.2 
 
 
427 aa  131  1e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.29 
 
 
415 aa  132  1e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  5.68946e-05 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.27 
 
 
501 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  32.42 
 
 
414 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  32.91 
 
 
429 aa  130  4e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  29.38 
 
 
407 aa  130  4e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  31.45 
 
 
405 aa  129  9e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  31.2 
 
 
402 aa  127  2e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  34.58 
 
 
409 aa  128  2e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  33.77 
 
 
431 aa  127  4e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  31.75 
 
 
437 aa  127  4e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.37 
 
 
406 aa  126  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  29.79 
 
 
414 aa  126  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  33.33 
 
 
431 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.49 
 
 
405 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  32.68 
 
 
453 aa  124  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.33271e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.86 
 
 
406 aa  123  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  33.99 
 
 
427 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  30.41 
 
 
417 aa  121  2e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  32.01 
 
 
425 aa  120  2e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  33.12 
 
 
406 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  33.12 
 
 
402 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  33.66 
 
 
440 aa  120  5e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.99 
 
 
430 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  31.1 
 
 
414 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  33.33 
 
 
379 aa  119  1e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  30.8 
 
 
437 aa  119  1e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  31.79 
 
 
425 aa  119  1e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  30.77 
 
 
423 aa  118  2e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.99 
 
 
409 aa  117  4e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.63 
 
 
465 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.44 
 
 
408 aa  115  1e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  31.73 
 
 
430 aa  114  2e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  31.53 
 
 
419 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>