More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5268 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 379 aa  745    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  38.44 
 
 		 425 aa  219  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  39.12 
 
 		 388 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  38.67 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  37.54 
 
 		 399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  39.83 
 
 		 391 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  37 
 
 		 424 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37 
 
 		 466 aa  212  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  38.46 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  36.04 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  35.95 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  37.03 
 
 		 401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  37.13 
 
 		 401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  36.86 
 
 		 427 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  36.29 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  35.5 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  37.32 
 
 		 421 aa  190  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  35.92 
 
 		 411 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.62 
 
 		 411 aa  189  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  35.65 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  34.3 
 
 		 517 aa  179  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  37.16 
 
 		 400 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  34.19 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  30.66 
 
 		 450 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  30.45 
 
 		 447 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  29.58 
 
 		 494 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  34.15 
 
 		 464 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  31.19 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  29.58 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.71 
 
 		 465 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  30.59 
 
 		 405 aa  159  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  32.35 
 
 		 424 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  29.49 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  32.16 
 
 		 348 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  29.18 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  42.11 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  39.81 
 
 		 370 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  38.68 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  28.39 
 
 		 381 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  33.92 
 
 		 483 aa  100  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  31.6 
 
 		 607 aa  99.4  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.41 
 
 		 723 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.52 
 
 		 723 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 		 643 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  33.52 
 
 		 725 aa  93.2  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  29.49 
 
 		 614 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  35.84 
 
 		 564 aa  92.8  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  26.64 
 
 		 911 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.3 
 
 		 797 aa  90.9  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  28.99 
 
 		 483 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  28.99 
 
 		 483 aa  90.5  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  34.91 
 
 		 740 aa  90.5  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  33.7 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  32.54 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  31.61 
 
 		 667 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  30.74 
 
 		 632 aa  87  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 		 746 aa  86.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.13 
 
 		 637 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  25.99 
 
 		 701 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.82 
 
 		 656 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.58 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  33.52 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.25 
 
 		 672 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  31.61 
 
 		 702 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  29.61 
 
 		 638 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  26.26 
 
 		 712 aa  84.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  28.5 
 
 		 861 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.47 
 
 		 658 aa  84  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  27.89 
 
 		 701 aa  83.6  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  32.89 
 
 		 864 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  33.53 
 
 		 582 aa  83.2  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.11 
 
 		 737 aa  83.2  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  32.65 
 
 		 571 aa  82.8  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5211  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.71 
 
 		 529 aa  82.8  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  33.53 
 
 		 577 aa  82.8  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  27.98 
 
 		 744 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.92 
 
 		 585 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0730  hypothetical protein  31.58 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0710  hypothetical protein  31.58 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  31.79 
 
 		 859 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.11 
 
 		 735 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  27.83 
 
 		 760 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.41 
 
 		 858 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  31.82 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.65 
 
 		 696 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  33.13 
 
 		 558 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 		 632 aa  81.3  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  32.45 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.6 
 
 		 936 aa  80.9  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  29.21 
 
 		 717 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  31.94 
 
 		 645 aa  79.7  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  29.35 
 
 		 675 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  26.86 
 
 		 759 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  30.4 
 
 		 699 aa  79.7  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  29.41 
 
 		 431 aa  79.3  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  26.63 
 
 		 860 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  33.56 
 
 		 574 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  30.73 
 
 		 561 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  27.5 
 
 		 1119 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>